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shenhai1315

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】势能面最后数据提取

大家好:
我最近学习做一个分子的势能面扫描,但是我发现用刚性扫描scan的话,最后列出来了二面角和能量值.但是如果用柔性opt=modredun 扫描的话最后列出来的是每一个扫描点的所有结构参数,这样我扫描100个点,我要提取好多个能量和扫描的二面角.现在麻烦大家有这方面经验的帮下忙, 看如何提取这些数据或者有软件的话也麻烦给我一份,非常感谢.
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1楼 2011-03-29 17:41:44
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xj544

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zhou2009(金币+3): 2011-04-20 15:48:37
引用回帖:
Originally posted by shenhai1315 at 2011-03-29 17:41:44:
大家好:
我最近学习做一个分子的势能面扫描,但是我发现用刚性扫描scan的话,最后列出来了二面角和能量值.但是如果用柔性opt=modredun 扫描的话最后列出来的是每一个扫描点的所有结构参数,这样我扫描100个点,我要提 ...

提取能量和二面角，可以在输出文件中ctrl+F,查找，查找出关键字，逐个提取。
其实能量可以在打开的scan图中，右击，save data，纵坐标就是能量。二面角就无能为力了，逐个提取吧
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2楼2011-04-20 15:27:11
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wanghanlu

银虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
二面角是自己设的固定参数，不要提取吧。
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3楼2011-04-22 10:44:10
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小鱼儿2008

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
好像只能手动提取
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4楼2011-04-22 15:40:03
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suosuosky

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by shenhai1315 at 2011-03-29 17:41:44:
大家好:
我最近学习做一个分子的势能面扫描,但是我发现用刚性扫描scan的话,最后列出来了二面角和能量值.但是如果用柔性opt=modredun 扫描的话最后列出来的是每一个扫描点的所有结构参数,这样我扫描100个点,我要提 ...

我也想问同一个问题，你现在知道怎样提取了吗？

请问在搜索输出文件的时候，使用什么关键词来搜索到能量值吗？

谢谢！
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5楼2011-05-26 09:18:04
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