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tjuZidan

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】提取势能面上点的坐标 已有2人参与

我用opt(modredundant) 以两个键长为变量做了势能面,现在想把11*11=121个点的坐标提取出来存在一个文件里,应该怎么做,我对编程了解不多,会一点C,谢谢大家
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别以后想起又是遗憾
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kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫

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gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-05-25 19:30:07
不用会编程啊,你用GVIEW打开out文件,然后result-scan,从图上选出你要的坐标,然后将此结构另存为你想要的格式就可以了啊
我们在为了文章而搞科研
2楼2010-05-25 18:51:15
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tjuZidan

木虫 (小有名气)

可能是我没说清楚?我要所有点的坐标,在.log里有Summary of Optimized Potential Surface Scan对吧,但是这个结果键长键角和二面角比输入文件里的多啊,我想要在一个文件里把它们一个一个的列出来(point 1,coordinates;point 2,coordinates。。。),用笛卡尔坐标的形式,你说的方法只能存一个点,不能批处理啊
别以后想起又是遗憾
3楼2010-05-25 19:18:00
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kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫

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aylayl08(金币+1):谢谢交流 2010-05-26 14:39:07
我也遇到过这样的,当初我想提出数据来画图,没办法,就从势能图上把坐标一个一个的提出来了,希望你找到更好的办法
我们在为了文章而搞科研
4楼2010-05-25 21:30:53
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