应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请做过RAPD的虫子支招
81/1返回列表
查看: 964  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yangjie86

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】请做过RAPD的虫子支招

我现在要做RAPD筛选一组特异性的序列，但是不知道RAPD引物筛选要注意什么。很多人都说RAPD是不大可靠的，但是如果幸运，也能找到想要的特异性片段。前段时间根据别人用RAPD筛选的序列做了组TaqMan引物和探针，结果悲剧的特异性不好，还不是引物的特异性不好，是序列本身就不是特异性片段。唉，也怪自己当时只在NCBI上进行了比对，没有实验验证一下引物。现在迷茫中，准备自己做RAPD，筛选特异性序列。请做过RAPD的虫虫们，给介绍一下引物筛选的注意事项。

[ Last edited by 1949stone on 2011-9-29 at 11:42 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-03-29 13:16:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

terry130

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-03-29 16:43:05
yangjie86(金币+2): 2011-03-29 21:55:16
硕士的时候做过，很遥远了。。。RAPD不是用的10bp的随机引物吗？我记得当初做的时候是订购了一大批随机引物，然后一个一个试，最后选几个在个体间存在较大差异且背景很干净的引物。进一步进行种内遗传多样性的比对。感觉怎么跟你说的这个不是一个东西呢。。。。。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-03-29 15:23:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangjie86

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by terry130 at 2011-03-29 15:23:10:
硕士的时候做过，很遥远了。。。RAPD不是用的10bp的随机引物吗？我记得当初做的时候是订购了一大批随机引物，然后一个一个试，最后选几个在个体间存在较大差异且背景很干净的引物。进一步进行种内遗传多样性的比对 ...

是的，RAPD一般是这样做的。但很多文献中说如果知道是什么物种，而且别人已经筛选过相似的序列的话，可以从其中筛选几个条带比较好的序列来做，这样筛选出现条带到的几率比较大。
赞一下 回复此楼
3楼2011-03-29 21:58:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

terry130

木虫 (正式写手)
★ ★
dhd997(金币+2): 欢迎交流 2011-03-30 08:11:15
yangjie86(金币+2): 2011-03-30 08:53:55
引用回帖:
Originally posted by yangjie86 at 2011-03-29 21:58:50:
是的，RAPD一般是这样做的。但很多文献中说如果知道是什么物种，而且别人已经筛选过相似的序列的话，可以从其中筛选几个条带比较好的序列来做，这样筛选出现条带到的几率比较大。

原来是这个意思啊。。。10bp引物很便宜的，买它几十个也无所谓啊。RAPD敏感性很高，同一个物种在不同的区域都会有很大差异的。这种东西最好还是自己筛选，另外你的引文是不是中文的？？中文的话最好无视。。。。大家都懂的。。。不解释。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-03-30 07:25:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangjie86

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by terry130 at 2011-03-30 07:25:25:
原来是这个意思啊。。。10bp引物很便宜的，买它几十个也无所谓啊。RAPD敏感性很高，同一个物种在不同的区域都会有很大差异的。这种东西最好还是自己筛选，另外你的引文是不是中文的？？中文的话最好无视。。。。 ...

多谢指导！原来引用的序列是中国人发的英文，现在筛选的引物都是外国人发的英文文献中的。
赞一下 回复此楼
5楼2011-03-30 08:56:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张小逸

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
wanhscn(金币+2): 鼓励新虫发帖！引物是通用的！ 2011-09-29 11:16:49
引用回帖:
2楼: Originally posted by terry130 at 2011-03-29 15:23:10:
硕士的时候做过，很遥远了。。。RAPD不是用的10bp的随机引物吗？我记得当初做的时候是订购了一大批随机引物，然后一个一个试，最后选几个在个体间存在较大差异且背景很干净的引物。进一步进行种内遗传多样性的比对 ...

我是新手，最近也要做RAPD，请问引物如何让设计？一般设计多少呢？谢谢
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2011-09-29 10:21:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongyansd

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
你做的是植物还是动物的啊？我做鱼类的RAPD分析，希望指导一下
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2011-11-29 20:08:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
莫小邪6楼
2011-03-30 09:17   回复  
yangjie86(金币+1): 2011-03-30 11:07:48
dhd997: 求助交流帖子，最好不要只是为了一个金币而来。 2011-03-30 13:07:36
相关版块跳转 我要订阅楼主 yangjie86 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学工程321分求调剂 +7 大米饭！ 2026-03-15 7/350 2026-03-16 10:25 by 了了了了。。
[硕博家园] 深圳大学硕士招生（2026秋，传感器方向，仅录取第一志愿） +4 xujiaoszu 2026-03-11 8/400 2026-03-16 09:45 by xujiaoszu
[考研] 环境工程调剂 +3 大可digkids 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:09 by DDDddddmm
[考研] 调剂 +8 调剂的考研学生 2026-03-09 8/400 2026-03-15 22:14 by Winj1e
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +6 zlingli 2026-03-13 6/300 2026-03-15 20:00 by ryzcf
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-15 3/150 2026-03-15 09:12 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +7 邱gl 2026-03-10 11/550 2026-03-14 12:18 by 邱gl
[考研] 一志愿浙江大学0856材料与化工求调剂 +4 yansheng@211 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:10 by JourneyLucky
[考研] 云南财经大学信息学院计算机学硕专硕学位点 +3 zjptai 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:23 by 飞行琦
[考研] 一志愿郑大070303，338分，求调剂 +4 dadawaf 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:20 by lsw010101
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿江南大学环境工程085701 +3 Djdjj12 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:31 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +8 zchqwer 2026-03-10 8/400 2026-03-14 00:01 by JourneyLucky
[考研] 复试调剂 +9 Copy267 2026-03-10 9/450 2026-03-13 23:45 by userper
[考研] 336求调剂 +6 Iuruoh 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:06 by JourneyLucky
[考研] ［0860］321分求调剂，ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 332求调剂 +3 Zz版 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:36 by 18595523086
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
[考研] 279求调剂 +3 莫xiao 2026-03-10 4/200 2026-03-11 08:06 by 斩魂滴兔子！
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭