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lv840716

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】抗癌药物-凋亡-western

大家好,我是western得新手,最近在做一个化合物的抗癌作用,关于促进凋亡的,在做MAPK 通路时,发现了些问题,请大家帮忙解决一下吧,谢谢了
(1)western做出来的结果随着浓度增加,不仅磷酸化的JNK,p38增加,而且总的JNK,p38也升高,这样正常吗?
(2)结果还显示随着浓度增加,磷酸化的ERK1/2降低,总的ERK1/2增加,这样正常吗?
谢谢大家了。。。。。。。
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terry130

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+8): good 2011-03-26 08:46:30
lv840716(金币+5): 2011-03-26 13:30:28
引用回帖:
Originally posted by lv840716 at 2011-03-25 16:47:56:
那请问,怎么解释呢?

有变化是好事啊,就怕没有变化呢。首先你要确定这个变化的稳定性,你的需要重复实验三次左右,每次run gel的时候 loading control和target protein都要在一张膜上进行western,要保证你的loading control bands很平,这样才能证明结果的可信性。

确定结果可信后,这个结果就是很不错的了。总蛋白浓度的变化和磷酸化水平的变化不一致是很正常的现象。总蛋白浓度的升高可以有两种方式:一种是转录水平的提高,这个不能用western来证明,需要做RTPCR来检测mRNA水平。另一种是转录后调控造成的总蛋白浓度变化,比如negative regulateor或者positive regulateor蛋白的浓度或活性的变化造成的,或者是蛋白本身进行转录后修饰后在细胞内half-life period的变化。
而磷酸化其实就是蛋白转录后修饰的一种,一般的是在你加药物后改变了细胞内环境,触发了某条信号通路,激活了一些上游的激酶,这些激酶进而磷酸化了下游的蛋白。这个过程跟总蛋白浓度的变化没有必然的联系的。磷酸化的作用也是多元化的,有些是改变蛋白的生物活性,有些是改变蛋白的稳定性和细胞内定位。
要解释你的现象你需要对相关的信号通路有足够的了解,而且光一个western是不够的,你可能需要对你怀疑的相关信号蛋白都做western,或者做一些RTPCR实验。
8楼2011-03-26 08:33:58
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lv840716

银虫 (小有名气)


怎么没人回复了?我顶一顶。。。。。。。。。
2楼2011-03-23 09:15:42
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lv840716

银虫 (小有名气)


怎么没人回答啊?
5楼2011-03-25 08:24:00
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terry130

木虫 (正式写手)


★
lv840716(金币+1):谢谢参与
lv840716(金币+1): 2011-03-25 16:48:06
不能用正不正常来评价药物处理后的蛋白浓度变化,只要western结果重复性好,那这个现象就是事实,你只是需要去解释它而已。
6楼2011-03-25 13:38:58
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