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lv840716

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助/交流】抗癌药物-凋亡-western

大家好，我是western得新手，最近在做一个化合物的抗癌作用，关于促进凋亡的，在做MAPK 通路时，发现了些问题，请大家帮忙解决一下吧，谢谢了
（1）western做出来的结果随着浓度增加，不仅磷酸化的JNK，p38增加，而且总的JNK，p38也升高，这样正常吗？
（2）结果还显示随着浓度增加，磷酸化的ERK1/2降低，总的ERK1/2增加，这样正常吗？
谢谢大家了。。。。。。。

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1楼 2011-03-22 22:51:43

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terry130

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+8): good 2011-03-26 08:46:30
lv840716(金币+5): 2011-03-26 13:30:28

引用回帖:

Originally posted by lv840716 at 2011-03-25 16:47:56:
那请问，怎么解释呢？

有变化是好事啊，就怕没有变化呢。首先你要确定这个变化的稳定性，你的需要重复实验三次左右，每次run gel的时候 loading control和target protein都要在一张膜上进行western，要保证你的loading control bands很平，这样才能证明结果的可信性。

确定结果可信后，这个结果就是很不错的了。总蛋白浓度的变化和磷酸化水平的变化不一致是很正常的现象。总蛋白浓度的升高可以有两种方式：一种是转录水平的提高，这个不能用western来证明，需要做RTPCR来检测mRNA水平。另一种是转录后调控造成的总蛋白浓度变化，比如negative regulateor或者positive regulateor蛋白的浓度或活性的变化造成的，或者是蛋白本身进行转录后修饰后在细胞内half-life period的变化。
而磷酸化其实就是蛋白转录后修饰的一种，一般的是在你加药物后改变了细胞内环境，触发了某条信号通路，激活了一些上游的激酶，这些激酶进而磷酸化了下游的蛋白。这个过程跟总蛋白浓度的变化没有必然的联系的。磷酸化的作用也是多元化的，有些是改变蛋白的生物活性，有些是改变蛋白的稳定性和细胞内定位。
要解释你的现象你需要对相关的信号通路有足够的了解，而且光一个western是不够的，你可能需要对你怀疑的相关信号蛋白都做western，或者做一些RTPCR实验。