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xuwei0909

至尊木虫 (著名写手)

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[交流] 【请教】这个C错误怎么解决？

PLAT369 Type_2 Test for long C3 - C3 (Angstrom Difference) XRAY: 1.34
--------------------------------------------------------------------------------

Large deviations from generally accepted values may indicate model problems,
over refinement etc.  Default C3-C3 = 1.34 Ang. (X-Ray) value from
Ladd & Palmer, Structure Determination by Xray Crystallography (1985).
Note:
  - C3-C3 indicates a bond between atoms with 4 with 3 bonds each.
  - Conjugated systems may cause some 'false alarm' messages.
  - A notable exception is the C-C bond in -C(=O)-C(=O)- systems with an
observed mean value of 1.54 Angstrom.

是羧基碳原子与苯环碳原子间的C-C单键距离太长，结构里C-C单键距离只有1.53左右（也不算长啊），是不是Conjugated systems may cause some 'false alarm' messages这样的原因造成，如何解决是好，请各位高手帮忙!

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1楼 2011-03-22 09:17:18

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xuwei0909

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部分结构如图

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7楼2011-03-22 21:10:08

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xuwei0909

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Alert level C
PLAT369_ALERT_2_C Long C(sp2)-C(sp2) Bond  C1    - C6    ...    1.53 Ang.
PLAT369_ALERT_2_C Long C(sp2)-C(sp2) Bond  C5    - C9    ...    1.53 Ang.
PLAT369_ALERT_2_C Long C(sp2)-C(sp2) Bond  C10 - C15 ...    1.53 Ang.

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2楼2011-03-22 09:56:34

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