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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】大家的 DNAman 软件能够识别sal I酶切位点吗？试试看。
汕头大学海洋科学接受调剂
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hkfgwww

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】大家的 DNAman 软件能够识别sal I酶切位点吗？试试看。

sal I识别的酶切位点为：GTCGAC

随便选择则一段含有sal I酶切位点序列：
GTCGACgggggggggggggGTCGAC。
含有两个sal酶切位点。

使用DNAman软件分析这段序列含有的酶切位点。

分析结果为：

Screened with 118 enzymes, 2 sites found
SalI  G/TCGAC  2:   1, 20

List by Site Order
1       SalI        20      SalI        

Non Cut Enzymes
AatII       Acc65I      AccIII      AclI        AflII       AgeI
AhaIII      Alw44I      AlwNI       ApaBI       ApaI        ApaLI
AscI        Asp718I     AsuII       AvrII       BalI        BamHI
BbeI        BbvII       BclI        BglI        BglII       Bpu1102I
Bsc91I      BsiI        BsmI        Bsp1407I    BspHI       BspMI
BspMII      BssHII      BstD102I    BstEII      BstXI       Bsu36I
ClaI        Csp45I      CspI        CvnI        DraI        DraIII
DrdI        EagI        Eam1105I    Ecl136II    Eco31I      Eco47III
Eco52I      Eco56I      Eco57I      Eco72I      EcoICRI     EcoNI
EcoRI       EcoRV       EheI        EspI        FseI        HindIII
HpaI        I-PpoI      KpnI        MfeI        Mlu113I     MluI
MscI        MstI        MstII       NaeI        NarI        NcoI
NdeI        NheI        NotI        NruI        NsiI        PacI
PflMI       PinAI       PmaCI       PmeI        PstI        PvuI
PvuII       RleAI       SacI        SacII    sal I      SapI
SauI        ScaI        SciI        SfiI        SgrAI       SmaI
SnaBI       SpeI        SphI        SplI        SpoI        SrfI
SspI        SstI        SstII       StuI        SunI        SwaI
Tth111I     VspI        XbaI        XcmI        XhoI        XmaI
XmaIII      XmnI        XorII


大家看见没有，在List by Site Order；Non Cut Enzymes 栏目都出现了sal I酶切位点。

你们的DNAman软件还有这个问题吗？

[ Last edited by hkfgwww on 2011-4-5 at 09:06 ]
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1楼 2011-03-20 19:03:43
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hkfgwww

银虫 (正式写手)
????
回复此楼
2楼2011-03-20 20:54:23
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fxiyue

铁杆木虫 (著名写手)
★
hkfgwww(金币+1):谢谢参与
估计很多人都搞不懂呢吧
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-03-20 21:34:59
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hkfgwww

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by fxiyue at 2011-03-20 21:34:59:
估计很多人都搞不懂呢吧

你们用什么软件分析一段基因的酶切位点呢？ 为设计引物引入酶切位点做准备。
赞一下 回复此楼
4楼2011-03-20 21:45:07
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gongeleven

铁杆木虫 (正式写手)
★
hkfgwww(金币+1):谢谢参与
我用clone manager
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-03-20 23:20:15
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dreaming0816

金虫 (著名写手)
★
hkfgwww(金币+1):谢谢参与
难道是其它酶切位点可以检查，只有Sac 1不行？有什么特殊的吗？
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-04-03 17:38:00
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hkfgwww

银虫 (正式写手)
★ ★
dhd997(金币+2): 可以把问题编辑在一楼啊 2011-04-05 08:49:59
引用回帖:
Originally posted by dreaming0816 at 2011-04-03 17:38:00:
难道是其它酶切位点可以检查，只有Sac 1不行？有什么特殊的吗？

别的酶没有问题。解决了，这个软件能够识别两个sal 不同的I酶切位点（及其相似），可能是软件漏洞。
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2011-04-04 18:45:16
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youyi

铜虫 (小有名气)
★
hkfgwww(金币+1): 谢谢参与
没有
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8楼2014-10-07 10:25:20
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