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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】在NCBI中检索遇到的问题
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lzhaowin

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】在NCBI中检索遇到的问题

因为要设计芯片，所以开始在genebank中检索某一酶的基因，如输入检索词：rumen和xylanase，检索到208条信息。

无意中还是用rumen和xylanase在protein中检索，发现竟然有713条信息！

突然间懵了，我是用那208条基因信息呢，还是一条一条去查看这713条蛋白序列的基因序列，再用这713条蛋白序列的基因序列？？？

为什么在protein中检索的比在genebank中检索的多这么多？？

或者各位大侠有什么更好的办法搜集这些序列？

谢谢大家~

[ Last edited by lzhaowin on 2011-3-11 at 17:55 ]
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1楼 2011-03-11 17:52:40
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zhengfan1109

银虫 (正式写手)
★
amisking(金币+1): 鼓励发帖交流。 2011-03-11 20:46:57
lzhaowin(金币+5): 谢谢~ 2011-03-13 10:17:59
只是
基因序列都知道了，还要去找它的蛋白序列吗？

有些蛋白序列测定了，没有测基因序列，还有一些事跟这个蛋白相关的信息，所有蛋白的结果比较多。
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2楼2011-03-11 18:03:34
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zdq516122164

新虫 (小有名气)
这个问题 我也遇到了
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3楼2011-03-11 21:16:40
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John_5696

铁虫 (初入文坛)
lzhaowin(金币+5): 谢谢~ 2011-03-13 10:20:06
可能是因为一条基因可以表达不同的蛋白，我查的很多基因就可以表达出不同的蛋白变体variant和isoform，只要确定了基因序列就行了，这些蛋白异构体的活性一般都是一致的。
另外也要注意选择你的物种。
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4楼2011-03-11 23:41:10
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