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569480531

金虫 (小有名气)

linda

[交流] 【求助】g09总是把分子优化散掉 已有6人参与

各位大侠在用g9吗,我在溶剂中优化分子时总是出现分子被优化散掉的情况,请问各位有什么解决办法吗?
我的输入:
#P b3lyp/6-31G* scrf(solvent=DichloroEthane)
   opt(calcfc,maxstep=1,gdiis)
   iop(2/16=1) iop(5/13=1)
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mscic

金虫 (正式写手)

★ ★
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zhou2009(金币+1): 2011-03-06 11:29:53
你的初始结构是在气相优化好了的吧?可能在溶液里的结构不一样呢,因为有溶剂分子的作用。
2楼2011-03-04 13:14:46
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569480531

金虫 (小有名气)

linda

引用回帖:
Originally posted by mscic at 2011-03-04 13:14:46:
你的初始结构是在气相优化好了的吧?可能在溶液里的结构不一样呢,因为有溶剂分子的作用。

我用gaussview5画完图直接在溶剂中优化的,没有在气态中优化,您的意思是说初始结构不好才优化散的吗。
3楼2011-03-04 14:35:28
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mscic

金虫 (正式写手)


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引用回帖:
Originally posted by mscic at 2011-03-04 13:14:46:
你的初始结构是在气相优化好了的吧?可能在溶液里的结构不一样呢,因为有溶剂分子的作用。

当然有可能是初始结构不好,试试气相的,比较一下。
4楼2011-03-04 20:39:33
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mchen10

金虫 (正式写手)

先做气相优化 得到的结果在溶剂中重新优化吧
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
5楼2011-03-05 08:14:43
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569480531

金虫 (小有名气)

linda

我本打算省掉气相优化直接在溶剂中优化,看来不做气相优化问题也不少,那我就先做气相优化再在溶剂中优化吧,谢谢各位指教。
6楼2011-03-05 11:34:31
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yongma2008

木虫 (著名写手)

论文?苦!主。


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
先在气象下做, 再用检查点到液相下做,不会浪费很多时间的
7楼2011-03-05 22:33:48
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zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
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erylingjet(金币+5): 辛苦了! 2011-03-08 10:30:43
正象上述网友所说,先在气相优化好,然后再加溶剂。这样可以避免气相初始结构不合理引起的问题。
如果正确地加溶剂之后仍然被优化散掉,就要考虑散掉本就是符合实际的情况。你的分子极性如果很强,在极性溶剂中有可能优化散掉成为正负溶剂(水)合离子。

一般来说,如果计算正确,这计算结果对我们就像实验结果一样,它反映了客观存在的事实,是我们要正确解读、严格遵循的。根据计算所揭示的事实得出结论,改正我们初始的设想,而不是有先入之见,简单地找计算来说明我们的固有想法。

[ Last edited by zhou2009 on 2011-3-6 at 11:59 ]
8楼2011-03-06 11:52:36
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569480531

金虫 (小有名气)

linda

引用回帖:
Originally posted by yongma2008 at 2011-03-05 22:33:48:
先在气象下做, 再用检查点到液相下做,不会浪费很多时间的

谢谢指教
9楼2011-03-06 17:14:03
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569480531

金虫 (小有名气)

linda

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-03-06 11:52:36:
正象上述网友所说,先在气相优化好,然后再加溶剂。这样可以避免气相初始结构不合理引起的问题。
如果正确地加溶剂之后仍然被优化散掉,就要考虑散掉本就是符合实际的情况。你的分子极性如果很强,在极性溶剂中有 ...

谢谢版主,小卒受教了。
10楼2011-03-06 17:15:05
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