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yuxuehanbing

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】RNA抽提260/230比值很小 已有5人参与

用Tirzol抽提组织总RNA,几次试验结果260/280比值和电泳图的结果都还不错,没有蛋白质和DNA的污染,但260/230比值都只在0.5左右,这是什么原因????
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雨山丰色

铁虫 (初入文坛)

★ ★ ★
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dhd997(金币+2): 鼓励交流 2011-03-24 16:35:32
可能多糖没有去干净,含有较多的多糖
3楼2011-03-24 14:31:10
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gaoyang636

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
比值小,可能是230吸收过高,也许有较多量的小离子污染
2楼2011-03-10 19:00:21
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cxt86

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1): 鼓励交流 2011-03-25 08:24:48
260/230低主要原因是盐离子残留,用70%乙醇洗两次会显著改善
4楼2011-03-24 20:10:26
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+8): 谢谢交流 2011-03-25 08:25:14
前几天有人问过类似问题了。
260/230的值,一般不要小于2.0,小的话表明有异硫氰酸胍,β-巯基乙醇或乙醇的残留。补救的方法是再沉淀一次,然后重复乙醇洗涤的过程。但从我的经验看,后面RNA丢得很多……因此提RNA时就注意了

个人经验,260/230偏小的话,提取时可以改进以下几点:
1. 加氯仿抽提后取少一点上清,不要贪多。
2.加乙醇洗的时候,多晃几次,尽量让RNA沉淀整片悬浮起来(有时候确实浮不起来也没办法。)
3.弃乙醇的时候,用枪吸而不是倾倒,倒的话经常有液滴留在管壁上,倒不干净。第一次用蓝枪头吸,可以不完全吸干,免得吸到沉淀;然后短暂离心把残余酒精甩到管底,看准了用白枪头尽量吸干净。RNA量大,被白枪头弄掉一点也没关系。
4.溶解前晾干的时间可以长一点,5分钟也没关系的。标准的做法说是不能晾太久,等沉淀开始变透明就要加水溶解,但是我晾过10分钟的,后面RNA量也很大。可能量大,虽然有些溶解不了,最后浓度还是高。

可能不完全正确,但是以前我出现过260/230偏小的问题,按上面方法改进了操作,后面就好了。

还有一种原因可能是多糖类杂质残留,可试试用LiCl沉淀。
5楼2011-03-24 22:01:08
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