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【求助/交流】启动子与5UTR区的困惑
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lxjwishes
银虫
(正式写手)
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(幼儿园)
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虫号: 646075
[交流]
【求助/交流】启动子与5UTR区的困惑
在甘蔗扩增一个基因的启动子,扩了好久都没有扩出来,而我这个基因的基因组结构是这样的,如图1
而我最近看的一篇文献,他们做的基因跟我的情况一样,在5'端非编码区有两段内含子,但是他做的上游调控元件分析如图2-C,不知道是不是我的理解有错,他的分析是从起始密码子的上游就开始做分析,那他们岂不是就是将
内含子作为调控序列来分析的。
而启动子的定义是:启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,那么就是说需扩增出基因5‘端上游的基因组序列,才能够拿来做分析,是不是这样的呢?
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2011-03-01 09:35:01
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seahow
木虫
(著名写手)
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★
lxjwishes(金币
+1
):谢谢参与
lxjwishes(金币+1): 2011-03-15 09:05:27
5UTR和promoter不矛盾,UTR是对CDS而言。
promoter实际上是control seq,一般包括UTR,但比UTR长许多。
intron很多时候有调控功能。
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5楼
2011-03-09 18:06:49
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w.king124
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★
lxjwishes(金币
+1
):谢谢参与
lxjwishes(金币+1): 2011-03-01 15:43:00
1.在研究启动子的时候,应该尽量向5‘端上溯,以防错漏可能的调控序列
2、有时候,transposon参与调控的话会发生在更远的距离
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2楼
2011-03-01 10:56:41
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bijing_1111
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★
lxjwishes(金币
+1
):谢谢参与
由于转录起始位点之后会有部分序列对转录有影响,所以一般会将翻译起始位点之前的序列一起做分析。但如果你要研究启动子活性,尽量扩增外显子1的序列就可以了,内含子不会对结果有很大影响的。
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3楼
2011-03-09 17:11:26
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lxjwishes(金币
+1
):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by
w.king124
at 2011-03-01 10:56:41:
1.在研究启动子的时候,应该尽量向5‘端上溯,以防错漏可能的调控序列
2、有时候,transposon参与调控的话会发生在更远的距离
正解
有的调控序列离基因有很远的距离
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4楼
2011-03-09 17:38:00
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