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downer

铁虫 (初入文坛)


[交流] 【求助/交流】请问用什么软件可以搜某一基因是否含某段序列?

已知的序列具有简并性,也就是说序列不是完全确定的

如何定位这个基因上这段序列的位置呢?

Thanks
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1949stone(金币+1): 谢谢交流 2011-02-26 18:33:51
downer(金币+10): 确实可以实现 2011-02-27 10:33:29
用Clustal 做alignment
2楼2011-02-26 18:17:15
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小球藻

银虫 (初入文坛)



rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-26 19:54:26
NCBI上blast好像可以吧
3楼2011-02-26 18:38:49
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tanxi125

银虫 (小有名气)


同意楼上的,NCBI里面的blast有这个功能!
4楼2011-02-26 18:42:41
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sph150

金虫 (小有名气)


dnaman软件,很好用
5楼2011-02-26 21:02:48
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downer

铁虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by sph150 at 2011-02-26 21:02:48:
dnaman软件,很好用

DNAMAN只能做ATGC序列的比对,有兼并的碱基并不识别,我发帖前试过的...
6楼2011-02-27 10:27:03
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翱宇

禁虫 (正式写手)


我一般用Vector NTI这个软件!
7楼2011-02-27 10:28:38
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downer

铁虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-02-26 18:17:15:
用Clustal 做alignment

忘记了这个软件了,试了下,确实可以
Thanks!

btw:10个金币已送
8楼2011-02-27 10:34:02
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windy891230

新虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送鲜花一朵
我找不到小麦的BAS1基因,那我怎么用EST设计引物啊 求大侠帮帮忙!还有怎么使用DNAMAN这个软件啊
9楼2012-07-31 12:33:01
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