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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请问用什么软件可以搜某一基因是否含某段序列？
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downer

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】请问用什么软件可以搜某一基因是否含某段序列？

已知的序列具有简并性，也就是说序列不是完全确定的

如何定位这个基因上这段序列的位置呢？

Thanks
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windy891230

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1楼 2011-02-26 18:14:07
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
★
1949stone(金币+1): 谢谢交流 2011-02-26 18:33:51
downer(金币+10): 确实可以实现 2011-02-27 10:33:29
用Clustal 做alignment
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2楼2011-02-26 18:17:15
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小球藻

银虫 (初入文坛)
★
rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-26 19:54:26
NCBI上blast好像可以吧
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3楼2011-02-26 18:38:49
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tanxi125

银虫 (小有名气)
同意楼上的，NCBI里面的blast有这个功能！
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4楼2011-02-26 18:42:41
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sph150

金虫 (小有名气)
dnaman软件，很好用
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5楼2011-02-26 21:02:48
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downer

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by sph150 at 2011-02-26 21:02:48:
dnaman软件，很好用

DNAMAN只能做ATGC序列的比对，有兼并的碱基并不识别，我发帖前试过的...
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6楼2011-02-27 10:27:03
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翱宇

禁虫 (正式写手)
我一般用Vector NTI这个软件！
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7楼2011-02-27 10:28:38
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downer

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-02-26 18:17:15:
用Clustal 做alignment

忘记了这个软件了，试了下，确实可以
Thanks！

btw:10个金币已送
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8楼2011-02-27 10:34:02
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windy891230

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵
我找不到小麦的BAS1基因，那我怎么用EST设计引物啊 求大侠帮帮忙！还有怎么使用DNAMAN这个软件啊
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9楼2012-07-31 12:33:01
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