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yongma2008

木虫 (著名写手)


[交流] 【求助】cif文件中,显示水分子有两个氧原子是怎么回事呢?

cif文件是我从ccdc网站申请来的,不知道为什么水分子会有两个氧原子,特来请教,谢谢
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)



yongma2008(金币+10): 氧原子的问题解决了,但不明白什么叫“加氢还需要提高” 2011-02-22 02:20:27
wsht212(金币+1): 2011-02-24 17:51:42
引用回帖:
Originally posted by yongma2008 at 2011-02-21 15:58:17:
cif文件是我从ccdc网站申请来的,不知道为什么水分子会有两个氧原子,特来请教,谢谢

你以前问过吧?
那时候没有上传cif,恐怕谁也搞不懂你的意思。

你是指的O13A ,O13B吧?

首先,这两个O属于一个水的统计分布,就是说这个水有点无序,它有时候在O13A的位置,有时候在O13B的位置,几率各为50%, 而H131, H132是他们共同的H. 这是作者的处理。

其次, 这样处理是可以的,但H131, H132与O13A O13B的距离不够合理, 就是说加氢还需要提高。
2楼2011-02-22 01:57:15
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oyljw

至尊木虫 (职业作家)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
加氢还需要提高是指还可以通过技术操作(可以是用命令在解晶体软件比如shelx里面)把H---O距离固定得更接近于H---O的标准键长)
3楼2011-07-05 21:59:41
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