应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【请教】Squeeze使用
91/1返回列表
查看: 3795  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

konglingbing

木虫 (著名写手)

[交流] 【请教】Squeeze使用

MOF框架中的溶剂分子无序，
1：于是使用squeeze掉溶剂分子，因为自学，所以不知道自己的操作是否正确，请高手赐教具体步骤？
2：如果要使用OMIT命令，是squeeze掉后OMIT，还是先OMIT再squeeze
3：投稿时，不是要上传squeeze之前和squeeze之后的cif,这是指把squeeze之前处理好的数据，然后squeeze，做好cif--check上传,想问如果squeeze之后发现有问题是否还可以再精修数据，或者再加一些限制命令，或者还能否OMIT
4: 对于MOF，最后完成度达到最低多少可以发表

[ Last edited by konglingbing on 2011-2-17 at 13:26 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-02-16 22:51:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

腾龙云飞

金虫 (著名写手)
konglingbing(金币+3): 2011-02-25 20:37:07
个人认为：
1、用platon squeeze处理ins或者res，把sqf中的数据考入cif
2、omit可以放在最后用
3、squeeze之后数据一般都会变好，可以使用其它的命令修改数据到最完美。
4、好象是0.95，最好要大于0.97
另外，在溶剂分子能确认的情况下不建议使用squeeze，可以用低温等方法测试后实在无法确认才使用，并且在文章中要做说明。
赞一下 回复此楼
2楼2011-02-24 17:05:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2011-02-24 17:05:08:
个人认为：
1、用platon squeeze处理ins或者res，把sqf中的数据考入cif
2、omit可以放在最后用
3、squeeze之后数据一般都会变好，可以使用其它的命令修改数据到最完美。
4、好象是0.95，最好要大于0.97
另外 ...

请教squeeze 之后，产生的sqf文件中例如下面所示各代表什么
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
         1     0.000     0.000     0.000     653.2      37.9
         2    -0.024     0.499     0.499    2646.7     173.1
_platon_squeeze_details
; ?
;
怎么根据electrons in the void space per unit去推测溶剂
赞一下 回复此楼
3楼2011-02-25 20:41:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

腾龙云飞

金虫 (著名写手)
konglingbing(金币+1): 2011-02-25 21:52:55
引用回帖:
Originally posted by konglingbing at 2011-02-25 20:41:46:
请教squeeze 之后，产生的sqf文件中例如下面所示各代表什么
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
...

(residual electron density  xxxx e per unit cel) ÷ （electron density of solvent molecule such as water）
赞一下 回复此楼
4楼2011-02-25 21:15:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2011-02-25 21:15:12:
(residual electron density  xxxx e per unit cel) ÷ （electron density of solvent molecule such as water）

which one is residual electron density per unit cel?
赞一下 回复此楼
5楼2011-02-25 21:21:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

腾龙云飞

金虫 (著名写手)
★
nash603(金币+1): 谢谢回帖交流！欢迎常来晶体版！ 2011-02-26 11:08:56
电子残留密度，跟你说的这个electrons in the void space per unit差不多
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-02-25 22:01:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2011-02-25 22:01:13:
电子残留密度，跟你说的这个electrons in the void space per unit差不多

我可能没有表达清楚，
我想问的是从哪里得到电子残留密度
还有        
      1     0.000     0.000     0.000     653.2      37.9
         2    -0.024     0.499     0.499    2646.7     173.1
中37.9和173.1 是什么，是SQUEEZE 掉的电子吗
为什么有两组有时候甚至更多
赞一下 回复此楼
7楼2011-02-25 23:58:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maolC

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by 腾龙云飞 at 2011-02-25 22:01:13
电子残留密度，跟你说的这个electrons in the void space per unit差不多

求解 我用platon 总是没有sqf文件产生 是怎么回事啊？
赞一下 回复此楼
8楼2013-11-06 23:27:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiyue0106

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by maolC at 2013-11-06 23:27:17
求解 我用platon 总是没有sqf文件产生 是怎么回事啊？...

我也是，求解
回复此楼
9楼2016-10-14 11:04:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 konglingbing 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 8/400 2026-08-18 11:47 by gltch
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 5/250 2026-08-18 11:25 by 無關想念
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +43 医学老男孩 2026-08-13 97/4850 2026-08-18 11:07 by 医学老男孩
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +5 基诺咪客 2026-08-17 6/300 2026-08-18 11:06 by hunter无悔
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +12 Ldrop2023 2026-08-13 15/750 2026-08-17 15:02 by 小豌豆_发芽
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭