应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【请教】Squeeze使用
51/1返回列表
查看: 3495  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)

[交流] 【请教】Squeeze使用

MOF框架中的溶剂分子无序，
1：于是使用squeeze掉溶剂分子，因为自学，所以不知道自己的操作是否正确，请高手赐教具体步骤？
2：如果要使用OMIT命令，是squeeze掉后OMIT，还是先OMIT再squeeze
3：投稿时，不是要上传squeeze之前和squeeze之后的cif,这是指把squeeze之前处理好的数据，然后squeeze，做好cif--check上传,想问如果squeeze之后发现有问题是否还可以再精修数据，或者再加一些限制命令，或者还能否OMIT
4: 对于MOF，最后完成度达到最低多少可以发表

[ Last edited by konglingbing on 2011-2-17 at 13:26 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-02-16 22:51:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2011-02-25 22:01:13:
电子残留密度，跟你说的这个electrons in the void space per unit差不多

我可能没有表达清楚，
我想问的是从哪里得到电子残留密度
还有        
      1     0.000     0.000     0.000     653.2      37.9
         2    -0.024     0.499     0.499    2646.7     173.1
中37.9和173.1 是什么，是SQUEEZE 掉的电子吗
为什么有两组有时候甚至更多
赞一下 回复此楼
7楼2011-02-25 23:58:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

腾龙云飞

金虫 (著名写手)
konglingbing(金币+3): 2011-02-25 20:37:07
个人认为：
1、用platon squeeze处理ins或者res，把sqf中的数据考入cif
2、omit可以放在最后用
3、squeeze之后数据一般都会变好，可以使用其它的命令修改数据到最完美。
4、好象是0.95，最好要大于0.97
另外，在溶剂分子能确认的情况下不建议使用squeeze，可以用低温等方法测试后实在无法确认才使用，并且在文章中要做说明。
赞一下 回复此楼
2楼2011-02-24 17:05:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2011-02-24 17:05:08:
个人认为：
1、用platon squeeze处理ins或者res，把sqf中的数据考入cif
2、omit可以放在最后用
3、squeeze之后数据一般都会变好，可以使用其它的命令修改数据到最完美。
4、好象是0.95，最好要大于0.97
另外 ...

请教squeeze 之后，产生的sqf文件中例如下面所示各代表什么
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
         1     0.000     0.000     0.000     653.2      37.9
         2    -0.024     0.499     0.499    2646.7     173.1
_platon_squeeze_details
; ?
;
怎么根据electrons in the void space per unit去推测溶剂
赞一下 回复此楼
3楼2011-02-25 20:41:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

腾龙云飞

金虫 (著名写手)
konglingbing(金币+1): 2011-02-25 21:52:55
引用回帖:
Originally posted by konglingbing at 2011-02-25 20:41:46:
请教squeeze 之后，产生的sqf文件中例如下面所示各代表什么
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
...

(residual electron density  xxxx e per unit cel) ÷ （electron density of solvent molecule such as water）
赞一下 回复此楼
4楼2011-02-25 21:15:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿安大生物学07初试322、本科二本、调剂求助 +10 李多米lee. 2026-04-12 11/550 2026-04-12 22:58 by yuyin1233
[考研] 290求调剂 +14 柯淮然 2026-04-12 16/800 2026-04-12 19:22 by dan_wang
[考研] 生物学308求调剂 +5 相信必会光芒万� 2026-04-11 5/250 2026-04-12 18:14 by zhouxiaoyu
[考研] 295分求调剂 +13 ?要上岸? 2026-04-10 13/650 2026-04-12 15:37 by laoshidan
[考研] 本科南方医科大学 一志愿985 药学学硕284分 求调剂 +5 弱水听文 2026-04-09 5/250 2026-04-12 13:16 by shengxi123
[考研] 求调剂，一志愿材料科学与工程985，365分， +8 材化李可 2026-04-11 10/500 2026-04-12 08:42 by 852137818
[考研] 调剂 +6 青灯不负 2026-04-09 6/300 2026-04-11 20:35 by dongdian1
[考研] 311求调剂 +13 xyp想读书 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:41 by 猪会飞
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +6 白云123456789 2026-04-09 8/400 2026-04-10 21:13 by zhouxiaoyu
[考研] 368求调剂 +3 17385968172 2026-04-10 3/150 2026-04-10 20:12 by 电子奥德彪
[考研] 287求调剂 +15 Fnhc 2026-04-07 21/1050 2026-04-10 19:09 by chemisry
[考研] 一志愿矿大，材料工程专硕314分，0856可调都可以 +15 无懈可击的巨人 2026-04-09 15/750 2026-04-10 18:10 by hmn_wj
[考研] 机械专368 有去处吗 +4 种大树 2026-04-10 4/200 2026-04-10 15:31 by jiajinhpu
[考研] 0702物理学学硕299求调剂 +6 祁柒连 2026-04-06 6/300 2026-04-10 11:10 by Roomoo
[考研] 332，085601求调剂 +12 ydfyh 2026-04-09 14/700 2026-04-09 17:28 by wp06
[考研] 085501机械英二77总分294求调剂，接受跨专业学习 +6 守法公民亓纪 2026-04-08 6/300 2026-04-09 15:55 by wp06
[考研] 材料考研求调剂总分280 +30 mkjlz1 2026-04-06 35/1750 2026-04-08 21:25 by cyh—315
[考研] 287求调剂 +6 Fnhc 2026-04-07 6/300 2026-04-08 10:05 by xingguangj
[考研] 11408 325分 +3 jgtxuxgkx 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:10 by lbsjt
[考研] 调剂 +4 mcbbc 2026-04-06 5/250 2026-04-07 12:33 by upczlm1989
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭