应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【请教】Squeeze使用
51/1返回列表
查看: 3448  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)

[交流] 【请教】Squeeze使用

MOF框架中的溶剂分子无序，
1：于是使用squeeze掉溶剂分子，因为自学，所以不知道自己的操作是否正确，请高手赐教具体步骤？
2：如果要使用OMIT命令，是squeeze掉后OMIT，还是先OMIT再squeeze
3：投稿时，不是要上传squeeze之前和squeeze之后的cif,这是指把squeeze之前处理好的数据，然后squeeze，做好cif--check上传,想问如果squeeze之后发现有问题是否还可以再精修数据，或者再加一些限制命令，或者还能否OMIT
4: 对于MOF，最后完成度达到最低多少可以发表

[ Last edited by konglingbing on 2011-2-17 at 13:26 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-02-16 22:51:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiyue0106

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by maolC at 2013-11-06 23:27:17
求解 我用platon 总是没有sqf文件产生 是怎么回事啊？...

我也是，求解
回复此楼
9楼2016-10-14 11:04:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

腾龙云飞

金虫 (著名写手)
konglingbing(金币+3): 2011-02-25 20:37:07
个人认为：
1、用platon squeeze处理ins或者res，把sqf中的数据考入cif
2、omit可以放在最后用
3、squeeze之后数据一般都会变好，可以使用其它的命令修改数据到最完美。
4、好象是0.95，最好要大于0.97
另外，在溶剂分子能确认的情况下不建议使用squeeze，可以用低温等方法测试后实在无法确认才使用，并且在文章中要做说明。
赞一下 回复此楼
2楼2011-02-24 17:05:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2011-02-24 17:05:08:
个人认为：
1、用platon squeeze处理ins或者res，把sqf中的数据考入cif
2、omit可以放在最后用
3、squeeze之后数据一般都会变好，可以使用其它的命令修改数据到最完美。
4、好象是0.95，最好要大于0.97
另外 ...

请教squeeze 之后，产生的sqf文件中例如下面所示各代表什么
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
         1     0.000     0.000     0.000     653.2      37.9
         2    -0.024     0.499     0.499    2646.7     173.1
_platon_squeeze_details
; ?
;
怎么根据electrons in the void space per unit去推测溶剂
赞一下 回复此楼
3楼2011-02-25 20:41:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

腾龙云飞

金虫 (著名写手)
konglingbing(金币+1): 2011-02-25 21:52:55
引用回帖:
Originally posted by konglingbing at 2011-02-25 20:41:46:
请教squeeze 之后，产生的sqf文件中例如下面所示各代表什么
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
...

(residual electron density  xxxx e per unit cel) ÷ （electron density of solvent molecule such as water）
赞一下 回复此楼
4楼2011-02-25 21:15:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 323求调剂 +6 洼小桶 2026-03-18 6/300 2026-03-23 00:29 by king123！
[考研] 310求调剂 +4 baibai1314 2026-03-16 4/200 2026-03-22 20:19 by edmund7
[考研] 生物学调剂 +5 Surekei 2026-03-21 5/250 2026-03-22 14:39 by tcx007
[考研] 一志愿070300浙大化学358分，求调剂！ +3 酥酥鱼.. 2026-03-21 3/150 2026-03-22 11:31 by 杨杨杨紫
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +4 NIFFFfff 2026-03-20 4/200 2026-03-22 09:49 by 2026paper
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 313求调剂 +4 肆叁贰壹22 2026-03-19 4/200 2026-03-21 17:33 by ColorlessPI
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 求调剂 +3 Ma_xt 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:05 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +4 葵梓卫队 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:02 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +11 Ymlll 2026-03-18 15/750 2026-03-20 19:40 by 丁丁*
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂（0854都可以） +4 xbxudjdn 2026-03-18 4/200 2026-03-20 09:07 by 不168
[考研] 材料与化工求调剂 +7 为学666 2026-03-16 7/350 2026-03-19 14:48 by 尽舜尧1
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 材料专硕306英一数二 +10 z1z2z3879 2026-03-16 13/650 2026-03-18 14:20 by 007_lilei
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭