应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【请教】Squeeze使用
汕头大学海洋科学接受调剂
51/1返回列表
查看: 3503  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)

[交流] 【请教】Squeeze使用

MOF框架中的溶剂分子无序，
1：于是使用squeeze掉溶剂分子，因为自学，所以不知道自己的操作是否正确，请高手赐教具体步骤？
2：如果要使用OMIT命令，是squeeze掉后OMIT，还是先OMIT再squeeze
3：投稿时，不是要上传squeeze之前和squeeze之后的cif,这是指把squeeze之前处理好的数据，然后squeeze，做好cif--check上传,想问如果squeeze之后发现有问题是否还可以再精修数据，或者再加一些限制命令，或者还能否OMIT
4: 对于MOF，最后完成度达到最低多少可以发表

[ Last edited by konglingbing on 2011-2-17 at 13:26 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-02-16 22:51:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maolC

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by 腾龙云飞 at 2011-02-25 22:01:13
电子残留密度，跟你说的这个electrons in the void space per unit差不多

求解 我用platon 总是没有sqf文件产生 是怎么回事啊？
赞一下 回复此楼
8楼2013-11-06 23:27:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

腾龙云飞

金虫 (著名写手)
konglingbing(金币+3): 2011-02-25 20:37:07
个人认为：
1、用platon squeeze处理ins或者res，把sqf中的数据考入cif
2、omit可以放在最后用
3、squeeze之后数据一般都会变好，可以使用其它的命令修改数据到最完美。
4、好象是0.95，最好要大于0.97
另外，在溶剂分子能确认的情况下不建议使用squeeze，可以用低温等方法测试后实在无法确认才使用，并且在文章中要做说明。
赞一下 回复此楼
2楼2011-02-24 17:05:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

konglingbing

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2011-02-24 17:05:08:
个人认为：
1、用platon squeeze处理ins或者res，把sqf中的数据考入cif
2、omit可以放在最后用
3、squeeze之后数据一般都会变好，可以使用其它的命令修改数据到最完美。
4、好象是0.95，最好要大于0.97
另外 ...

请教squeeze 之后，产生的sqf文件中例如下面所示各代表什么
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
         1     0.000     0.000     0.000     653.2      37.9
         2    -0.024     0.499     0.499    2646.7     173.1
_platon_squeeze_details
; ?
;
怎么根据electrons in the void space per unit去推测溶剂
赞一下 回复此楼
3楼2011-02-25 20:41:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

腾龙云飞

金虫 (著名写手)
konglingbing(金币+1): 2011-02-25 21:52:55
引用回帖:
Originally posted by konglingbing at 2011-02-25 20:41:46:
请教squeeze 之后，产生的sqf文件中例如下面所示各代表什么
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
...

(residual electron density  xxxx e per unit cel) ÷ （electron density of solvent molecule such as water）
赞一下 回复此楼
4楼2011-02-25 21:15:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 生物学308分求调剂（一志愿华东师大）做过分子实验 +9 相信必会光芒万� 2026-04-07 10/500 2026-04-13 10:20 by 可淡不可忘
[考研] 279求调剂 +9 张番茄不炒蛋 2026-04-11 9/450 2026-04-12 22:22 by paopaotu326
[找工作] 山东高校教师考核超级无底线，员工过不下去啦 +4 qut2026 2026-04-09 9/450 2026-04-12 00:54 by qut2026
[考研] 计算机22408 281分，求调剂 +7 17715607211 2026-04-06 7/350 2026-04-12 00:43 by xuxiang
[考研] 药学305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-10 8/400 2026-04-12 00:07 by zhouwenxian
[考研] 化学308分求调剂 +22 你好明天你好 2026-04-07 24/1200 2026-04-11 11:14 by ChemPharm
[考研] 300分求调剂 （085501机械专硕，本科扬大） +8 xu@841019 2026-04-11 8/400 2026-04-11 10:46 by qingpingzhu
[考研] 281求调剂 +11 觉得好的吧 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:35 by 逆水乘风
[考研] 22408调剂求助 +7 毂12 2026-04-09 9/450 2026-04-11 09:23 by 哦哦123
[考研] 材料与化工调剂 +12 否极泰来2026 2026-04-10 13/650 2026-04-11 00:28 by wangjihu
[考研] 293调剂 +25 yj1221 2026-04-08 26/1300 2026-04-10 15:02 by 柴小白
[考研] 一志愿华东师范生物学326分，求调剂 +8 刘墨墨 2026-04-09 8/400 2026-04-10 12:00 by pengliang8036
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +20 慕绝cc 2026-04-09 24/1200 2026-04-10 10:22 by xujun0624
[考研] 086004 求调剂 309 +7 Yin DY 2026-04-08 7/350 2026-04-09 13:59 by Delta2012
[考研] 328求调剂 +17 lftmya 2026-04-07 18/900 2026-04-09 08:05 by 5268321
[考研] 327求调剂 +10 Xxjc1107. 2026-04-06 11/550 2026-04-09 01:21 by lature00
[考研] 353求调剂 +8 晴空万里air 2026-04-07 8/400 2026-04-09 00:18 by GouQ
[考研] 270求调剂 +3 031127 2026-04-06 4/200 2026-04-08 21:00 by 逆水乘风
[考研] 求调剂，现在还能填的 +3 上岸小莹加油 2026-04-08 3/150 2026-04-08 14:30 by zhq0425
[考研] 287求调剂 +6 Fnhc 2026-04-07 6/300 2026-04-08 10:05 by xingguangj
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭