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[交流]
【请教】关于二面角
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各位晶体版的虫虫学长学姐： 请问晶体的二面角是怎么算出来的？是软件给出的还是自己根据键长键角手工计算的？小弟实在不懂，望各位大哥大姐教教我。 |
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2楼2011-02-15 22:42:45
别人总结的
★ ★
帝夫(金币+2): 感谢您的回复~假日快乐~~ 2011-02-16 00:37:52
wangwenlon(金币+3): 2011-02-16 09:07:45
帝夫(金币+2): 感谢您的回复~假日快乐~~ 2011-02-16 00:37:52
wangwenlon(金币+3): 2011-02-16 09:07:45
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1、Platon计算二面角 把ins文件输入到platon中，点击calculate all，在生成的lis文件中什么都有了，包括你要的二面角。 2、Xp计算二面角 以a.res为例 XP》read a XP》fmol A1 A2 A3 A4 A5 B1 B2 B3 B4 B5 （将两个面上的原子读进） XP》mpln A1 A2 A3 A4 A5（列出第一个面上的原子） XP》mpln B1 B2 B3 B4 B5 （列出第二个面上的原子）立即会给出第二个面与第一个面的二面角值。 3、Diamond计算二面角 （1）、用diamond打开你的晶体结构数据； （2）、按住ctrl键，用鼠标复选中构成第一个平面的原子，比如苯环就是6个原子；（3）、点面板上的"Objects"－－"Planes"－－"Creat Plane Through atoms"创建第一个平面； （4）、按照3的方法创建第二个平面； （5）、点面板上的"Tools"－－"Calculate"－－"Angle Between Planes"就可以就看到了对话框下面的角度。 4、Mercury中计算二面角 （1）、Mercury打开文件； （2）、选中组成第一个面的几个原子； （3）、Calculate—Planes--（对话框中即有你选中的几个原子）--New Planes—重新出现一个 对 话框---选中picked atoms---OK---回到一个对话框—Close （4）、Mercury中产生两个新的面（红色） （5）、 右上方"Picking Mode"栏Measure Angles—选中平面1和平面2即有两个平面的夹角。 |
3楼2011-02-15 23:49:56
4楼2011-02-16 15:40:29
5楼2011-02-17 10:46:57
6楼2011-02-17 18:13:02
7楼2011-02-18 21:55:10
