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[交流]
【请教】关于二面角
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各位晶体版的虫虫学长学姐: 请问晶体的二面角是怎么算出来的?是软件给出的还是自己根据键长键角手工计算的?小弟实在不懂,望各位大哥大姐教教我。 |
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2楼2011-02-15 22:42:45
别人总结的
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帝夫(金币+2): 感谢您的回复~假日快乐~~ 2011-02-16 00:37:52
wangwenlon(金币+3): 2011-02-16 09:07:45
帝夫(金币+2): 感谢您的回复~假日快乐~~ 2011-02-16 00:37:52
wangwenlon(金币+3): 2011-02-16 09:07:45
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1、Platon计算二面角 把ins文件输入到platon中,点击calculate all,在生成的lis文件中什么都有了,包括你要的二面角。 2、Xp计算二面角 以a.res为例 XP》read a XP》fmol A1 A2 A3 A4 A5 B1 B2 B3 B4 B5 (将两个面上的原子读进) XP》mpln A1 A2 A3 A4 A5(列出第一个面上的原子) XP》mpln B1 B2 B3 B4 B5 (列出第二个面上的原子)立即会给出第二个面与第一个面的二面角值。 3、Diamond计算二面角 (1)、用diamond打开你的晶体结构数据; (2)、按住ctrl键,用鼠标复选中构成第一个平面的原子,比如苯环就是6个原子;(3)、点面板上的"Objects"--"Planes"--"Creat Plane Through atoms"创建第一个平面; (4)、按照3的方法创建第二个平面; (5)、点面板上的"Tools"--"Calculate"--"Angle Between Planes"就可以就看到了对话框下面的角度。 4、Mercury中计算二面角 (1)、Mercury打开文件; (2)、选中组成第一个面的几个原子; (3)、Calculate—Planes--(对话框中即有你选中的几个原子)--New Planes—重新出现一个 对 话框---选中picked atoms---OK---回到一个对话框—Close (4)、Mercury中产生两个新的面(红色) (5)、 右上方"Picking Mode"栏Measure Angles—选中平面1和平面2即有两个平面的夹角。 |
3楼2011-02-15 23:49:56
4楼2011-02-16 15:40:29
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