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wangwenlon

木虫 (著名写手)


[交流] 【请教】关于二面角

各位晶体版的虫虫学长学姐:

      请问晶体的二面角是怎么算出来的?是软件给出的还是自己根据键长键角手工计算的?小弟实在不懂,望各位大哥大姐教教我。
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csl200

银虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
帝夫: 感谢您的回复!节日快乐~~ 2011-02-17 18:46:53
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2011-02-16 15:40:29:



注意一点,这些软件计算出来的数据可能是假的偏差, 不宜在正式出版时采用。

需要正式出版时采用的数据,得用方法才准确呢?谢谢
5楼2011-02-17 10:46:57
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


★ ★
帝夫(金币+2): 感谢您的回复~假日快乐~~ 2011-02-16 00:37:43
wangwenlon(金币+2): 2011-02-16 09:07:38
软件。

在.ins输入 mpla
具体看shelx说明书
2楼2011-02-15 22:42:45
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csl200

银虫 (正式写手)


别人总结的

★ ★
帝夫(金币+2): 感谢您的回复~假日快乐~~ 2011-02-16 00:37:52
wangwenlon(金币+3): 2011-02-16 09:07:45
1、Platon计算二面角
把ins文件输入到platon中,点击calculate all,在生成的lis文件中什么都有了,包括你要的二面角。
2、Xp计算二面角
以a.res为例
XP》read a
XP》fmol A1 A2 A3 A4 A5 B1 B2 B3 B4 B5  (将两个面上的原子读进)
XP》mpln A1 A2 A3 A4 A5(列出第一个面上的原子)
XP》mpln B1 B2 B3 B4 B5 (列出第二个面上的原子)立即会给出第二个面与第一个面的二面角值。
3、Diamond计算二面角
(1)、用diamond打开你的晶体结构数据;
(2)、按住ctrl键,用鼠标复选中构成第一个平面的原子,比如苯环就是6个原子;(3)、点面板上的"Objects"--"Planes"--"Creat Plane Through atoms"创建第一个平面;
(4)、按照3的方法创建第二个平面;
(5)、点面板上的"Tools"--"Calculate"--"Angle Between Planes"就可以就看到了对话框下面的角度。
4、Mercury中计算二面角
(1)、Mercury打开文件;
(2)、选中组成第一个面的几个原子;
(3)、Calculate—Planes--(对话框中即有你选中的几个原子)--New Planes—重新出现一个 对  
话框---选中picked atoms---OK---回到一个对话框—Close
(4)、Mercury中产生两个新的面(红色)
(5)、 右上方"Picking Mode"栏Measure Angles—选中平面1和平面2即有两个平面的夹角。
3楼2011-02-15 23:49:56
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
帝夫(金币+2): 感谢您的回复!节日快乐~~ 2011-02-17 18:46:43
引用回帖:
Originally posted by csl200 at 2011-02-17 10:46:57:


需要正式出版时采用的数据,得用方法才准确呢?谢谢

应该用结构精修过程中产生的数据。

其他我不清楚, 以shelx为例,
在.ins中加
mpla 6 c1 c2 c3 c4 c5 c6 c7
mpla 6 c11 c12 c13 c14 c15 c16 c17
然后精修,得到的数据在 .lst中可看到。
那个偏差是可信的。
6楼2011-02-17 18:13:02
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