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mmzhang

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于启动子区域克隆 已有10人参与

最近在构建GUS 载体,但是遇到了一个大问题:我已经通过多次的Tail-PCR得到了大约2000bp的启动子区域的序列(序列是根据几次的Tail-PCR测序结果拼接起来的),然后本人根据得到的序列设计了两对引物准备扩增得到片段并构建GUS载体,但是做了几次PCR后一个条带都没有,已经试了不同的PCR条件还是不行,我用的聚合酶是Takara的HS primerstar,现在不知道该怎么办了,请各位大侠能够提供一些意见和建议。
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rioarsenal

金虫 (正式写手)

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lstt09nk(金币+2): 感谢交流 2011-02-18 20:08:57
引用回帖:
Originally posted by mmzhang at 2011-02-15 16:45:18:
最近在构建GUS 载体,但是遇到了一个大问题:我已经通过多次的Tail-PCR得到了大约2000bp的启动子区域的序列(序列是根据几次的Tail-PCR测序结果拼接起来的),然后本人根据得到的序列设计了两对引物准备扩增得到片 ...

1、拼接错误

2、设计的引物PCR条件不对

3、可以考虑用巢式做一下,看是否能扩出来
8楼2011-02-18 14:39:12
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daydayup2005

银虫 (小有名气)

怀疑是不是拼接的有问题导致引物设计出现问题?
2楼2011-02-16 19:50:38
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mmzhang

新虫 (小有名气)

也考虑过这个问题,但是我重复了两次序列拼接,应该没有问题吧
3楼2011-02-18 09:46:12
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夏尔list

金虫 (著名写手)

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dhd997(金币+2): 谢谢交流 2011-02-18 10:48:49
其实我是想问一下,启动子连GUS的话,必须是精确到ATG前面么?多不行少也不行么?如果该基因前2000bp包括了另外一个基因的部分区域呢,它也算是启动子区域么?
4楼2011-02-18 09:50:19
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