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l123w456x789

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】southern blot问题 已有4人参与

southern blot试验中,杂交的探针根据自己需要随便多长吗?
如果杂交的DNA与探针不完全匹配,比如中间有1个或2个或某段有几个碱基不完全匹配,结果怎样呢?谢谢
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shaquila

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 如果有好的建议,可以回帖跟LZ交流一下~~ 2011-01-26 22:05:23
lz,你用化学显色吗,我看结果玄乎~~
这东西灵敏度很低的
4楼2011-01-25 20:40:26
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看天(金币+1): 鼓励一下 2011-01-25 22:09:11
引用回帖:
Originally posted by l123w456x789 at 2011-01-25 18:45:50:
southern blot试验中,杂交的探针根据自己需要随便多长吗?
如果杂交的DNA与探针不完全匹配,比如中间有1个或2个或某段有几个碱基不完全匹配,结果怎样呢?谢谢

不知楼主用的地高辛还是同位素,400bp-1kb均可,中间不完全匹配没太大影响,但楼主为何不用全匹配的序列呢?杂同源基因吗?
jiayoubashaonian
2楼2011-01-25 19:05:17
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l123w456x789

新虫 (初入文坛)

是的
若干个已知序列取部分做探针
提取DNA后想杂交
如果有的相差10个8个碱基,结果能区分吗?
是不是只有区别很大的才能区分呢?
一般结果要不曝光,要不化学显色反应,是不是不仅仅可以通过有无来区别,还可以通过颜色深浅来区别?
但是相差几个碱基不还是区别不了吗?请教~
3楼2011-01-25 19:43:22
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shaquila

金虫 (正式写手)

lz,你用化学显色吗,我看结果玄乎~~
这东西灵敏度很低的
5楼2011-01-25 20:42:16
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