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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】southern blot问题
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l123w456x789

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】southern blot问题 已有4人参与

southern blot试验中，杂交的探针根据自己需要随便多长吗？
如果杂交的DNA与探针不完全匹配，比如中间有1个或2个或某段有几个碱基不完全匹配，结果怎样呢？谢谢
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1楼 2011-01-25 18:45:50
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l123w456x789

新虫 (初入文坛)
是的
若干个已知序列取部分做探针
提取DNA后想杂交
如果有的相差10个8个碱基，结果能区分吗？
是不是只有区别很大的才能区分呢？
一般结果要不曝光，要不化学显色反应，是不是不仅仅可以通过有无来区别，还可以通过颜色深浅来区别？
但是相差几个碱基不还是区别不了吗？请教~
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3楼2011-01-25 19:43:22
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看天(金币+1): 鼓励一下 2011-01-25 22:09:11
引用回帖:
Originally posted by l123w456x789 at 2011-01-25 18:45:50:
southern blot试验中，杂交的探针根据自己需要随便多长吗？
如果杂交的DNA与探针不完全匹配，比如中间有1个或2个或某段有几个碱基不完全匹配，结果怎样呢？谢谢

不知楼主用的地高辛还是同位素，400bp-1kb均可，中间不完全匹配没太大影响，但楼主为何不用全匹配的序列呢？杂同源基因吗？
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jiayoubashaonian
2楼2011-01-25 19:05:17
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shaquila

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 如果有好的建议，可以回帖跟LZ交流一下~~ 2011-01-26 22:05:23
lz,你用化学显色吗，我看结果玄乎～～
这东西灵敏度很低的
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4楼2011-01-25 20:40:26
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shaquila

金虫 (正式写手)
lz,你用化学显色吗，我看结果玄乎～～
这东西灵敏度很低的
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5楼2011-01-25 20:42:16
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