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由田120516

新虫 (初入文坛)


[交流] 【求助/交流】基因敲除试验

我最近在做基因敲除试验,看了很多的文献,有一个问题一直让我很困惑,希望大家帮我解惑,谢谢!
我的方法是首先扩增要敲除的基因的全序列,并将其连接在骨架质粒pUC18的多克隆位点中,然后要将抗生素抗性基因插入到该基因中间,使其失活,从而构建用于基因敲除的自杀质粒。我不明白的是该抗生素抗性基因需要自己的启动子吗,还是它可以利用质粒本身的启动子进行转录翻译?
我看过很多文献,在这一点上都未做详细说明。但经过分析(查看抗生素抗性基因的长度),好像不需要自己的启动子。
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ouyangxian

新虫 (小有名气)



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引用回帖:
19楼: Originally posted by 黑盖儿 at 2013-10-08 13:27:17
你可以先用PUC18构建自杀质粒,然后转原生质体将自杀质粒导入目标菌株中,然后再提取目标菌株的基因组,做PCR,若结果呈阴性,那就说明敲除成功了,为保险起见,最后送到测序公司一下序列,如果测不出来,那就敲除 ...

你好!我也是做细菌基因敲除的,敲除后用PCR扩增,检测不到目的片段,测序也没有问题,可是做Western blot却能检测到目的蛋白,请问你有遇到过着情况吗?原因是啥?如何解决?谢谢!
20楼2014-01-16 17:13:20
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ouyangxian

新虫 (小有名气)



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一种情况是只是单链敲除了,双链敲除可能致死;另一种情况是技术本身的问题,重新构建,多挑几个克隆,总有一个是对的。
23楼2016-04-28 08:23:39
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