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zugulitang

金虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】怎么从结果中提取径向分布函数、键长、键角

我需要从vasp的计算结果中提取径向分布函数、键长、键角，一般都是说从PCDAT和XDATCAR中提取，XDATCAR中有三行，表示原子轨迹的？但是体系中有好几种原子，并且有几十个原子，怎么确定哪个是哪个的原子轨迹呢？具体PCDAT和XDATCAR这两个文件包含了哪些信息呢？哪个高手能出来说说吗？

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1楼 2011-01-16 15:03:36

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gzhao1980

铁虫 (初入文坛)

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★ ★
zugulitang(金币+1):谢谢参与
sunyang1988(金币+1): 谢谢指点 2011-02-19 09:37:14

引用回帖:

Originally posted by zugulitang at 2011-01-16 07:03:36:
我需要从vasp的计算结果中提取径向分布函数、键长、键角，一般都是说从PCDAT和XDATCAR中提取，XDATCAR中有三行，表示原子轨迹的？但是体系中有好几种原子，并且有几十个原子，怎么确定哪个是哪个的原子轨迹呢？具 ...

XDATCAR中应该是有3列吧，每列代表x,y,z，行数应该和POSCAR里面的行数一样，每一行代表一个原子，知道了原子坐标，用FOrtran编个程序就能求键长、键角、径向分布函数了。。。