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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】怎么从结果中提取径向分布函数、键长、键角
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zugulitang

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】怎么从结果中提取径向分布函数、键长、键角

我需要从vasp的计算结果中提取径向分布函数、键长、键角，一般都是说从PCDAT和XDATCAR中提取，XDATCAR中有三行，表示原子轨迹的？但是体系中有好几种原子，并且有几十个原子，怎么确定哪个是哪个的原子轨迹呢？具体PCDAT和XDATCAR这两个文件包含了哪些信息呢？哪个高手能出来说说吗？
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1楼 2011-01-16 15:03:36
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gzhao1980

铁虫 (初入文坛)
★ ★
zugulitang(金币+1):谢谢参与
sunyang1988(金币+1): 谢谢指点 2011-02-19 09:37:14
引用回帖:
Originally posted by zugulitang at 2011-01-16 07:03:36:
我需要从vasp的计算结果中提取径向分布函数、键长、键角，一般都是说从PCDAT和XDATCAR中提取，XDATCAR中有三行，表示原子轨迹的？但是体系中有好几种原子，并且有几十个原子，怎么确定哪个是哪个的原子轨迹呢？具 ...

XDATCAR中应该是有3列吧，每列代表x,y,z，行数应该和POSCAR里面的行数一样，每一行代表一个原子，知道了原子坐标，用FOrtran编个程序就能求键长、键角、径向分布函数了。。。
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9楼2011-02-19 09:30:28
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zugulitang

金虫 (正式写手)
欢迎大家来讨论！
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2楼2011-01-16 15:04:46
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zhang668

木虫 (正式写手)
★ ★
zugulitang(金币+1):谢谢参与
ellsaking(金币+1): 谢谢交流 2011-02-08 18:54:11
把结构图导入到MS下，可以手动测量。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-01-16 17:44:25
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zugulitang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhang668 at 2011-01-16 17:44:25:
把结构图导入到MS下，可以手动测量。

我没用MS，我是说那些数据怎么提取？
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4楼2011-01-16 17:46:32
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