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汕头大学海洋科学接受调剂
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guohuayin

木虫 (著名写手)


[交流] 【求助/交流】如何做多个DNA序列的蛋白质序列的比对?

我目前得到大量微生物同一基因的的DNA序列,可以直接对DNA序列进行比对,得到进化关系,我发现DNA序列存在着差异,同时我想进一步利用DNA序列进行相关蛋白质的序列比对. 因为考虑到DNA序列虽然有差异,但是在蛋白质水平上也许未必有差异.请问如何利用DNA序列进行蛋白质的比对呢?不想一个一个的翻译,觉得太麻烦了,有每没有专用的软件呢?可以直接把大量的DNA序列转为蛋白质序列进行比对?请了解朋友解释一下,多谢了.

[ Last edited by guohuayin on 2011-1-8 at 07:36 ]
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guohuayin

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 孤枫 at 2011-01-08 11:22:32:
仅知DNAMAN,先把每个序列翻译成蛋白序列,然后比对,不知你的大量是多大量

有一百多个序列,所以很多,一个一个的去做太需要时间了,有没有办法,直接把所有的序列进行蛋白质比对呢?多谢.
3楼2011-01-08 12:12:37
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孤枫

金虫 (小有名气)



dhd997(金币+1):鼓励交流 2011-01-08 12:19:02
guohuayin(金币+5):谢谢回复.希望能有更好的办法. 2011-01-08 12:26:14
仅知DNAMAN,先把每个序列翻译成蛋白序列,然后比对,不知你的大量是多大量
2楼2011-01-08 11:22:32
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hyw1989960

木虫 (正式写手)



rainwander(金币+1):Vector NTI挺好用的,功能还多~~~鼓励积极参与~~~ 2011-01-08 16:01:07
vector 可以同时对比n个序列
4楼2011-01-08 13:04:11
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孤枫

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by guohuayin at 2011-01-08 12:12:37:


有一百多个序列,所以很多,一个一个的去做太需要时间了,有没有办法,直接把所有的序列进行蛋白质比对呢?多谢.

这个还真不知道。。。感觉还是要先翻译啊,一百多个做起来是得花上一两个小时,。。
5楼2011-01-08 14:59:22
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