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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】小片段DNA测序（SNP）
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wml126

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】小片段DNA测序（SNP） 已有4人参与

我做SNP,有一个200bp左右的DNA片度要测序，PCR产物已经做了胶回收，检测胶回收产物亮度很淡，请教各位大侠，可以直接拿胶回收产物测序不?还是一定要做克隆呢？坐等·····谢谢啦·
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1楼 2010-12-22 11:09:33
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poog502

木虫 (正式写手)
★ ★
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silicare(金币+1):谢谢参与，可以正反双向测序的 2010-12-22 11:47:32
200bp左右的DNA片度测序，前面和后面的50bp几乎是不能用的，只剩100bp左右你用来分析的话，意义不大。
最好是连到载体测序。

不用正反测序的，200bp正向测序就可以了，反过来测序结果是一样的呀

[ Last edited by poog502 on 2010-12-22 at 12:42 ]
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5楼2010-12-22 11:20:02
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
★
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引用回帖:
Originally posted by wml126 at 2010-12-22 11:09:33:
我做SNP,有一个200bp左右的DNA片度要测序，PCR产物已经做了胶回收，检测胶回收产物亮度很淡，请教各位大侠，可以直接拿胶回收产物测序不?还是一定要做克隆呢？坐等·····谢谢啦·

浓度低了测序不好测。我觉得与其等测序结果还不如花两天做个克隆呢。
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2010-12-22 11:17:38
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virus2009

金虫 (正式写手)

人称 龙哥
★
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可以，他测序也是做PCR，条带淡一点的话只要不是看不见（1ul）就可以做，
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virus
3楼2010-12-22 11:17:42
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by wml126 at 2010-12-22 11:09:33:
我做SNP,有一个200bp左右的DNA片度要测序，PCR产物已经做了胶回收，检测胶回收产物亮度很淡，请教各位大侠，可以直接拿胶回收产物测序不?还是一定要做克隆呢？坐等·····谢谢啦·

再者，你的200bp的序列本来就很短。直接PCR产物测序，两端的几十bp都很杂乱，可用的信息就100多bp了。这还整啥。
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2010-12-22 11:19:46
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