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wml126

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】小片段DNA测序(SNP) 已有4人参与

我做SNP,有一个200bp左右的DNA片度要测序,PCR产物已经做了胶回收,检测胶回收产物亮度很淡,请教各位大侠,可以直接拿胶回收产物测序不?还是一定要做克隆呢?坐等·····谢谢啦·
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

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引用回帖:
Originally posted by wml126 at 2010-12-22 11:09:33:
我做SNP,有一个200bp左右的DNA片度要测序,PCR产物已经做了胶回收,检测胶回收产物亮度很淡,请教各位大侠,可以直接拿胶回收产物测序不?还是一定要做克隆呢?坐等·····谢谢啦·

浓度低了测序不好测。我觉得与其等测序结果还不如花两天做个克隆呢。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2010-12-22 11:17:38
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virus2009

金虫 (正式写手)

人称 龙哥

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可以,他测序也是做PCR,条带淡一点的话只要不是看不见(1ul)就可以做,
virus
3楼2010-12-22 11:17:42
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

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Originally posted by wml126 at 2010-12-22 11:09:33:
我做SNP,有一个200bp左右的DNA片度要测序,PCR产物已经做了胶回收,检测胶回收产物亮度很淡,请教各位大侠,可以直接拿胶回收产物测序不?还是一定要做克隆呢?坐等·····谢谢啦·

再者,你的200bp的序列本来就很短。直接PCR产物测序,两端的几十bp都很杂乱,可用的信息就100多bp了。这还整啥。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2010-12-22 11:19:46
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poog502

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare(金币+1):谢谢参与,可以正反双向测序的 2010-12-22 11:47:32
200bp左右的DNA片度测序,前面和后面的50bp几乎是不能用的,只剩100bp左右你用来分析的话,意义不大。
最好是连到载体测序。

不用正反测序的,200bp正向测序就可以了,反过来测序结果是一样的呀

[ Last edited by poog502 on 2010-12-22 at 12:42 ]
5楼2010-12-22 11:20:02
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wml126

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by virus2009 at 2010-12-22 11:17:42:
可以,他测序也是做PCR,条带淡一点的话只要不是看不见(1ul)就可以做,

嗯···多谢~这么讲只能克隆了·
6楼2010-12-22 13:47:29
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