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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】相同保存条件下古老样本DNA更易降解，哪位能讲讲其中的原理
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rechkov

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】相同保存条件下古老样本DNA更易降解，哪位能讲讲其中的原理

最近在做一个历史燕麦品种的遗传多样性分析，有一些DNA样品是从120年前的燕麦样本中提取的，当然这些燕麦种子都已经失去活力，无法发芽，所以DNA是直接从种子提取的。另外一些当代对照品种的DNA是从叶片提取的。我发现，同样在4度冰箱保存，经过两三天后历史品种的DNA降解就很明显，而从新鲜组织提取的DNA却可以保存几个月以上。当然如果在零下二十度保存，历史品种也很稳定。不知道哪位有这方面的经验，给讲解一下其中的原理。是不是由于古老材料的DNA更不稳定，如果有文献证明就更好了（我找了半天也没找到相关文献）。
另外需要指出的是，刚刚提取出来的古老材料DNA质量是很好的，AFLP谱带几乎与新鲜组织提取的一样，所以我想在DNA提取之前，古老材料的DNA几乎是完整的。
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1楼 2010-12-20 04:39:40
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rechkov

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by silicare at 2010-12-20 08:15:42:
你自己的实验能够说明这个问题吗

对照做了吗

做过几次重复？

古老样本有24个，新鲜样本70个，然后检测了34个SSR位点，几乎每个SSR位点都是对新鲜样本正常扩增，但对古老样本则出现问题。
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3楼2010-12-20 08:38:02
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)
你自己的实验能够说明这个问题吗

对照做了吗

做过几次重复？
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2楼2010-12-20 08:15:42
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
rechkov(金币+2):是呀，我也这么想过，只是找不到证据。 2010-12-20 16:42:42
引用回帖:
Originally posted by rechkov at 2010-12-20 04:39:40:
最近在做一个历史燕麦品种的遗传多样性分析，有一些DNA样品是从120年前的燕麦样本中提取的，当然这些燕麦种子都已经失去活力，无法发芽，所以DNA是直接从种子提取的。另外一些当代对照品种的DNA是从叶片提取的。我 ...

会不会跟DNA上面的一些个修饰相关，只是瞎猜的，呵呵。
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4楼2010-12-20 09:02:28
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)
rechkov(金币+1):谢谢关注。 2010-12-20 16:43:06
新米和老米的口感都不一样，当然会有改变
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5楼2010-12-20 11:36:05
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