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【求助】利用smiles码把分子结构拆解成指定的小基团，应该用什么算法？
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我用SMARTS码来表示基团，拆解以similes存储的分子结构，直接利用编码拆解好像行不通，难道要把基团和目标分子都转化为结构图，再利用图论的方法进行匹配吗？有做过这方面的朋友给点指导！ [ Last edited by ghcacj on 2010-12-16 at 13:08 ] |
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在另一处回答了。 这个不应该在分子模拟版。这是分子拓扑学，属于化学信息学（Chemoinformatics） 化学信息学释疑 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=220153 计算机化学和化学信息学联系和区别 http://muchong.com/viewarticle.php?id=237776 化学信息学是谁最先提出来的？ http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=238233 为什么说化学信息学不是文献检索？ http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=238892 关于计算机化学的书籍 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=237895 关于国内从事计算机化学研究的一些情况 http://muchong.com/viewarticle.php?id=237889 关于国外计算机化学研究的情况 http://muchong.com/viewarticle.php?id=237891 计算机辅助有机合成的历史与人物（中国） http://www.muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=369487 计算机辅助有机合成的历史与人物（外国） http://www.muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=369471 关于计算机辅助有机合成的更正与补充 http://www.muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=370655&fpage=2 五言长诗 谈《未来化学学科的发展趋势》 http://www.muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=374209 五言长诗：从外行人的眼里远看“21世纪的分析化学” http://www.muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=377887 ====================== 化学风光 惜 秦皇汉武，略懂炼丹， 唐宗宋祖，稍知煮药； 一代天骄，成吉思汗， 吃肉太多，吃菜太少。 俱往矣， 数风流人物， 还看今朝。 甲醇封眼， 乙二醇聚， 三鹿堵肾， 样样令你命逍遥。 化学中心， 右抱生命，左拥材料， 谁敢与尔比主要？ 活命要紧，顶帖紧要， 长命百岁凭自己， 万古长青靠干嚎。 ======================= 无题 恨天无柄，恨地无环 恨网有关，恨算有偏 还恨分子多构象 无法无规难找全 活性表现喜煞人 窃喜合成做不完 字字血来句句泪 CADD苦不堪 软件功能样样有 可惜参数难寻见 正版盗用且不论 说明晦涩公式煎 内存耗尽硬盘困 风扇频频尘满面 熬过黑夜CPU累 再盼白天偷清闲 自古英雄谁无死 皓首弓腰仍少年 马革裹尸尚有覆 肝脑涂地收不完 计算大旗谁高举 团团护卫缺宝剑 三尺龙泉镇邪去 赤手空拳焚香虔 岂料上帝非我佛 只认经费驳咱面 无可奈何花落去 重取西经再向前 本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2697410 |
2楼2010-12-16 10:41:47
