| 查看: 862 | 回复: 7 | |||
[交流]
【求助】MS遇到的问题 已有3人参与
|
|
1.discover能量最小化不收敛是什么原因？这样出来的结果可靠吗？ 2.数据不稳定，是不是体系未趋于平衡呢？怎么解决这个问题呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
291求调剂
已经有5人回复
-
药学专硕调剂
已经有10人回复
-
一志愿211，0703化学305分求调剂
已经有32人回复
-
求调剂
已经有9人回复
-
211本科材料化工求调剂
已经有13人回复
-
286求调剂
已经有23人回复
-
085410 273求调剂
已经有7人回复
-
291分调剂
已经有6人回复
-
310求调剂
已经有8人回复
-
药学305求调剂
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 有人遇到过MS文件读写错误的情况吗？
已经有4人回复
- MS培养基母液I的配置问题
已经有13人回复
- 新手遇到问题，求赐教
已经有3人回复
- ICP-MS测试样品遇到问题了，怎么解决？？
已经有13人回复
- 蛋白纯化遇到问题
已经有22人回复
- 有关MS 的建模 优化及计算的一些问题
已经有6人回复
- MS安装遇到问题 请求大家帮助
已经有4人回复
- MS | DPD中模拟胶束的问题
已经有4人回复
- MS刚刚学习，遇到了Method of object failed 请求指教
已经有12人回复
- 求助：Generic Host Process for Win32 Services遇到问题需要关闭
已经有4人回复
- 【求助】请问大家谁遇到过这样的问题，MS安装之后无法使用量键长键角的工具。送20个金
已经有3人回复
- 【求助】大家帮忙看一下这个LC/MS/MS的问题
已经有9人回复
- 【求助】按照ICSD的数据在MS中建模遇到原子相距太近怎么处理?
已经有10人回复
qphll
金虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 10
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 2708.7
- 散金: 2294
- 红花: 8
- 帖子: 554
- 在线: 227.1小时
- 虫号: 89654
- 注册: 2005-08-29
- 性别: GG
- 专业: 碳素材料与超硬材料
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4): 谢谢 2010-12-08 16:19:12
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4): 谢谢 2010-12-08 16:19:12
|
如果是有文献可以参照, 那么尽量先采用文献值; 如果是新的体系, 那么很多参数都是需要测试的. 你的两个问题其实反映的是同一个本质: 体系还未平衡. 建议: (1) 首先做minimization, 使得体系的overlap消除, 这样MD开始的那个初始构型比较合理; (2) 跑足一定的步数, 看能量是否收敛. 这里的收敛并不是要求能量就不变化了, 而是说能量在一个比较小的范围内周期震荡. 看你体系大小, 但是一般来讲如果1~2ns以后, 体系能量还是有很大的震荡, 那么需要考虑你的参数的使用是不是合理. 其实我也是'空对空', 以后提问记得上图. 一图胜千言. |
2楼2010-12-05 02:47:49
3楼2010-12-08 15:30:43
043114076
木虫 (正式写手)
- 应助: 49 (小学生)
- 金币: 3364.9
- 散金: 52
- 红花: 23
- 帖子: 788
- 在线: 369.5小时
- 虫号: 570592
- 注册: 2008-06-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2010-12-09 09:04:13
5楼2010-12-18 10:43:24
6楼2010-12-19 11:05:36
043114076
木虫 (正式写手)
- 应助: 49 (小学生)
- 金币: 3364.9
- 散金: 52
- 红花: 23
- 帖子: 788
- 在线: 369.5小时
- 虫号: 570592
- 注册: 2008-06-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
7楼2010-12-19 22:32:37
8楼2010-12-27 16:07:30
