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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 【求助】分子的LJ势能参数的拟合
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gjh123

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】分子的LJ势能参数的拟合

最近想做H2在COF中的吸附模拟，想自己拟合一下H2与COF中原子之间的力场参数。我现在能做出H2 与COF 上小构型之间的势能曲线来，但是不知道该怎么拟合才能得到H2 与COF 上原子之间的LJ势能参数来？哪位知道的能告诉我一下，奉送20个金币。
        以拟合C6H6 与H2分子之间的势能曲线为例： 我做出了C6H6 与H2分子之间的势能曲线了，怎么才能拟合出C、H_C6H6、 H_H2的LJ势能参数呢？
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1楼 2010-12-03 15:27:05
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fish.yfyh

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
很简单的, LJ = 4 epsilon [(sigma/r)^12 - (sigma/r)^6], 里面就2个参数, 对于不同原子就分别有epsilon和sigma。
既然你已经有了标准的势能曲线，用最小二乘拟合就行。
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7楼2013-12-13 18:59:14
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
gjh123(金币+5): 2010-12-04 09:53:09
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-12-04 17:12:16
引用回帖:
Originally posted by gjh123 at 2010-12-03 15:27:05:
最近想做H2在COF中的吸附模拟，想自己拟合一下H2与COF中原子之间的力场参数。我现在能做出H2 与COF 上小构型之间的势能曲线来，但是不知道该怎么拟合才能得到H2 与COF 上原子之间的LJ势能参数来？哪位知道的能告诉 ...

不过我记得徐莜杰的书上好像讲过怎么从量化计算得到的能量来拟合力场参数，只是那只是数学过程，而不是代码，你可以看一下，我觉得拟合力场参数，光靠ORIGIN是肯定不行的，肯定要写代码。
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3楼2010-12-04 08:47:12
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gjh123

金虫 (正式写手)
谢谢 zyj8119, 我对参数拟合的过程还不是很明白，先看看徐老师书上是怎么写的。 非常感谢zyj9119 的指点。
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4楼2010-12-04 09:54:55
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-12-04 17:12:27
引用回帖:
Originally posted by gjh123 at 2010-12-03 15:27:05:
最近想做H2在COF中的吸附模拟，想自己拟合一下H2与COF中原子之间的力场参数。我现在能做出H2 与COF 上小构型之间的势能曲线来，但是不知道该怎么拟合才能得到H2 与COF 上原子之间的LJ势能参数来？哪位知道的能告诉 ...

国人开发的一个软件1stopt很好，你可以尝试下。并且可以看一下这个帖子：
http://muchong.com/html/201006/2139520.html
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5楼2010-12-04 11:11:38
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zyj81192楼
2010-12-03 16:54   回复  
gjh123(金币+5): 2010-12-03 21:51:51
引用回帖:
Originally posted by gjh123 at 2010-12-03 15:27:05: 最近想做H2在COF中的吸附模拟，想自己拟合一下H2与COF中原子之间的力场参数。我现在能做出H2 与COF 上小构型之间的势能曲线来，但是不知道该怎么拟合才能得到H2 与COF 上原子之间的LJ势能参数来？哪位知道的能告诉 ...

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