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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】Autodock用于虚拟筛选
汕头大学海洋科学接受调剂
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mary0312332

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Autodock用于虚拟筛选

用Autodock做对接时，常会出现找不到H.map或 HD.map等问题。做单个对接的话还可以修改受体的GPF文件来解决，可是用于虚拟筛选时这种情况可怎么解决？
求高人指点

[ Last edited by mary0312332 on 2010-11-30 at 15:41 ]
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1楼 2010-11-30 15:39:53
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

caixin5120

木虫 (正式写手)
我一会做一个图 大家就知道了：）
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6楼2010-12-10 17:31:00
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普通回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
zh1987hs(金币+4):thank you 2010-12-10 16:45:06
在做grid的时候 在ligand准备的direct 的地方 添加 H HD，一般使用脚本批量处理需要筛选的分子，生成的文件里面会有所有分子包含的原子，挨个添加到 direct 那里，然后就可以做格点计算了，得到gpf文件。
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2楼2010-12-10 00:50:29
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75150618

铜虫 (小有名气)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
期待高手的解释
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3楼2010-12-10 12:29:43
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ustbwgs

木虫 (正式写手)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
同感
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4楼2010-12-10 12:32:27
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zoujin129

禁虫 (知名作家)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
本帖内容被屏蔽
5楼2010-12-10 13:05:41
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caixin5120

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+5):谢谢 2010-12-10 22:51:11
如图操作：）添加原子类型
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7楼2010-12-10 17:42:14
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pjiang

金虫 (正式写手)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
来学习一下
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8楼2010-12-11 00:48:42
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petersen

金虫 (小有名气)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
学习啦～帮忙顶上去！
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9楼2010-12-11 11:58:45
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wg423

超级版主 (文学泰斗)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
帮顶
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10楼2010-12-11 17:11:14
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0710811132

荣誉版主 (文学泰斗)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
不知道
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11楼2011-01-10 14:26:13
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我不是陈冠希

铜虫 (小有名气)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
不太清楚噢
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2386813&fpage=1
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12楼2011-01-10 22:19:29
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fiend_wing_bo

银虫 (小有名气)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
顶，学习一下！！
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13楼2011-03-07 13:06:45
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wjlouc

木虫 (正式写手)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
哈哈  原来如此
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14楼2011-03-07 13:14:23
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chongchong11

至尊木虫 (著名写手)
★
mary0312332(金币+3):谢谢参与
牛人是需要顶的呀。。
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15楼2011-03-21 20:29:56
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
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16楼2011-09-05 19:49:50
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)
★
mary0312332(金币+3): 谢谢参与
学习一下啊！
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17楼2012-04-03 20:36:31
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匿名

用户注销 (小有名气)
★
mary0312332(金币+3): 谢谢参与
本帖仅楼主可见
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18楼2014-11-06 09:15:25
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demyon

金虫 (初入文坛)
★
mary0312332(金币+3): 谢谢参与
遇到了相同的问题，请问您是解决了吗？
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19楼2015-02-08 19:34:05
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adts1115

捐助贵宾 (著名写手)
★
mary0312332(金币+3): 谢谢参与
内容已删除
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20楼2015-11-12 10:43:25
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fragrance12

新虫 (初入文坛)
★
mary0312332(金币+3): 谢谢参与
引用回帖:
6楼: Originally posted by caixin5120 at 2010-12-10 17:31:00
我一会做一个图 大家就知道了：）

可以再发一下图吗？
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21楼2016-05-20 22:09:47
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weibaichuan22楼
2016-05-21 08:54   回复  
mary0312332(金币+3): 谢谢参与
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