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小名阿飞

银虫 (初入文坛)


[交流] AMOVA分子方差分析SSR数据 数据怎么导入?求高手帮助

我现在在处理SSR数据,需要做一个AMOVA分析,用的是arlequin31软件,但是现在不会导入数据,请哪位高手指点。谢谢!
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xinfengy

铁杆木虫 (正式写手)


把数据存成.txt在往里导。
3楼2010-11-26 11:03:43
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dunqudey

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

2楼2010-11-26 10:54:53
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小名阿飞

银虫 (初入文坛)


恩,往TXT里存这个我知道,主要是存的是什么数据的啊?是存等位基因的频率?还是什么的?
[Profile]
  Title="A small example of microsatellite data"
NbSamples=4
GenotypicData=1
  #Unknown gametic phase between the 12 loci
GameticPhase=0
DataType=MICROSAT
LocusSeparator=WHITESPACE
[Data]
  [[Samples]]
SampleName="MICR1"
SampleSize=28
SampleData=  {
    Genot1  27  12 23 17
                13 22 16
    Genot2  1  15 22 16
               13 22 16
}
SampleName="MICR2"
SampleSize=59
SampleData=  {
    Genot3  37  12 24 18
                12 22 16
    Genot4  1  15 20 18
               13 22 18
    Genot5  21  14 22 16
                14 23 16
}
SampleName="MICR3"
SampleSize=30
SampleData=  {
    Genot6  17  12 21 16
                13 22 15
    Genot7  1  12 20 16
               13 23 16
    Genot8  12  10 22 15
                12 22 15
}
SampleName="MICR4"
SampleSize=16
SampleData=  {
    Genot9  15  13 24 16
                13 23 17
    Genot10 1   12 24 16
                13 23 16
}
[[Structure]]
  StructureName="Test microsat structure"
NbGroups=2
  #The first group is made up of the first 2 samples
Group={
    "MICR1"
    "MICR2"
      }
#The last 2 samples will be put into the second group
Group={
    "MICR3"
    "MICR4"
有这么个模板,但是不知道上面的数字我该用什么来换
4楼2010-11-28 21:46:32
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passingby

铜虫 (小有名气)


我也有这方面的疑问,和你共同期待解答
5楼2012-05-04 16:55:42
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