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小名阿飞

银虫 (初入文坛)

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[交流] AMOVA分子方差分析SSR数据数据怎么导入？求高手帮助

我现在在处理SSR数据，需要做一个AMOVA分析，用的是arlequin31软件，但是现在不会导入数据，请哪位高手指点。谢谢！

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1楼2010-11-26 10:31:21

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dunqudey

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

2楼2010-11-26 10:54:53

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xinfengy

铁杆木虫 (正式写手)

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把数据存成.txt在往里导。

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3楼2010-11-26 11:03:43

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小名阿飞

银虫 (初入文坛)

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在线: 6.1小时
虫号: 820623

恩，往TXT里存这个我知道，主要是存的是什么数据的啊？是存等位基因的频率？还是什么的？
[Profile]
  Title="A small example of microsatellite data"
NbSamples=4
GenotypicData=1
  #Unknown gametic phase between the 12 loci
GameticPhase=0
DataType=MICROSAT
LocusSeparator=WHITESPACE
[Data]
  [[Samples]]
SampleName="MICR1"
SampleSize=28
SampleData=  {
Genot1  27  12 23 17
            13 22 16
Genot2  1  15 22 16
            13 22 16
}
SampleName="MICR2"
SampleSize=59
SampleData=  {
Genot3  37  12 24 18
            12 22 16
Genot4  1  15 20 18
            13 22 18
Genot5  21  14 22 16
            14 23 16
}
SampleName="MICR3"
SampleSize=30
SampleData=  {
Genot6  17  12 21 16
            13 22 15
Genot7  1  12 20 16
            13 23 16
Genot8  12  10 22 15
            12 22 15
}
SampleName="MICR4"
SampleSize=16
SampleData=  {
Genot9  15  13 24 16
            13 23 17
Genot10 1 12 24 16
            13 23 16
}
[[Structure]]
  StructureName="Test microsat structure"
NbGroups=2
  #The first group is made up of the first 2 samples
Group={
"MICR1"
"MICR2"
   }
#The last 2 samples will be put into the second group
Group={
"MICR3"
"MICR4"
有这么个模板，但是不知道上面的数字我该用什么来换

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4楼2010-11-28 21:46:32

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