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zhangzhibo5898

铁虫 (小有名气)

月野兔

[交流] 【求助】我是做水分子模拟的这下子无语了 已有13人参与

我本来不是做模拟的,小女原是物理专业的,由于导师年轻,没有带学生经验,把几个招来的学生送到中科院的某组下,都转为做分子模拟。开始都不会,大家热情也高,三下五除二,每天热火朝天的看文献,讨论LINUX命令,讨论软件的使用,果然团体的力量就是大,几个月过去了,命令也熟悉了,这个过程还算顺当。开始找老板要体系做,为了达到预期的效果,我们几个白天黑夜的干,经常出来的东西不是我们要的,工夫不负有心人,终于想要的结果出来了,为了这样的结果体重也减轻了,精神上的磨难我们都可以接受。就算是入门了。论文是我们先自己写的,然后找导师提意见修改,现在已经是研三了,该找工作或者考虑读博士的时间,导师考虑我们时间紧张好心把论文都收过去,他来修改,剩下的问题由他解决。这个皮球就踢给了导师,能不能顺当好好的毕业就看论文能不能发了。几个月过去了,没有一点音讯,不是说没有消息便是好消息(NO NEWS IS GOOD NEWS)么,本想好家伙,两年多都没这么多自己忙自己喜欢干的事啦,现在终于有自己的时间,希望能好好利用。前几天,接到导师电话,说实验结论太浅,没有发表的可能性,这不是打击是什么,当初都是两边导师讨论后让我们做的,现在又讲这个,大家现在都很忙,硕士毕个业咋就那么费劲呢。我就是做了些前人已经做过的,但是用了粗粒化刚体和全原子三种模型做的模拟,讨论了10个温度下的RDF,和扩散。论文现在不能发真是无语。。。,请教高人给些指点,这样的结论能不能有新意哦?要么我现在挤出些时间,自己修改修改发个低一点的,但是最终还得通过导师同意,不知道这个方案可行不可行,要么就等着导师,不发就不毕业,NND大不了不毕业了。
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教育,工作,婚姻决定一个人是否幸福。向一辈子幸福前进。
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qphll

金虫 (正式写手)

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ghcacj(金币+5):谢谢 2010-11-25 14:02:45
引用回帖:
Originally posted by zhangzhibo5898 at 2010-11-25 10:12:13:
我本来不是做模拟的,小女原是物理专业的,由于导师年轻,没有带学生经验,把几个招来的学生送到中科院的某组下,都转为做分子模拟。开始都不会,大家热情也高,三下五除二,每天热火朝天的看文献,讨论LINUX命令 ...

有几个想法:

(1) 你想毕业以后接着读博, 还是去找工作了? 如果是后者, 那么支持你降低对文章的期望, 然后想着怎样尽快发表文章. 如果是前者, 请看(2)

(2) 对于水的模拟目前还没有定论. 这是坏消息, 也是好消息. 所以花些心思在文章的立意方面, 然后想一些是否还可以从结算结果里面分析一些新的性质, 或者能否找到比较理想的实验数据来互相对比.

(3) 如果方便, 请楼主贴出graphic abstract, 大家可以给你出出点子.
Life, Love, Laugh.
2楼2010-11-25 10:44:17
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老虎大王

木虫 (著名写手)

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ghcacj(金币+4):谢谢 2010-11-25 14:02:54
国内随便发个算了。研究工作本来是自己做着好玩的,现在逼着要发表,也没有办法。水的模拟太多了。有时候看人家做的好像也没有多大意思,也不知道人家的东西怎么就能发表。呵呵。
3楼2010-11-25 12:06:10
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zhangzhibo5898

铁虫 (小有名气)

月野兔

我想再算点数据,就是不知道还能算啥,从动力学结果除了RDF 和扩散信息还能从中得出什么呢?
教育,工作,婚姻决定一个人是否幸福。向一辈子幸福前进。
4楼2010-11-27 07:52:13
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祝愿你早日毕业!

5楼2010-11-27 09:17:44
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piaoma

木虫 (小有名气)

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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-27 13:14:05
可以再算点H-Bond,配位数啊什么的。水的确给人做烂了,除非有很好的idea,否则不太好发文章
6楼2010-11-27 10:27:00
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qphll

金虫 (正式写手)

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-11-27 13:14:16
引用回帖:
Originally posted by zhangzhibo5898 at 2010-11-27 07:52:13:
我想再算点数据,就是不知道还能算啥,从动力学结果除了RDF 和扩散信息还能从中得出什么呢?

楼主提到了扩散信息, 楼下有人提到了氢键. 如果能结合这两个, 看看扩散信息随着那些因素改变, 如何往增强或者减弱扩散的地方调控; 计算一下氢键寿命, 看看结构的稳定, 然后再能结合量化给一些电子层面的解释. 那么是不是就丰满一些了呢?

仅供参考.
Life, Love, Laugh.
7楼2010-11-27 12:24:25
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kwx19822003

铜虫 (小有名气)

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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-27 13:14:23
最简单的也是最困难的,好算的人家早算了,能算的大家都在算,不好算的就需要下功夫了,只要功夫下到了,相信一定能有好结果。
8楼2010-11-27 13:02:06
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fu19871111

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zhangzhibo5898 at 2010-11-27 07:52:13:
我想再算点数据,就是不知道还能算啥,从动力学结果除了RDF 和扩散信息还能从中得出什么呢?

我想问一下你是怎么用RDF来表征氢键的? 就是具体怎么操作  能否共享下  谢谢
9楼2010-11-28 09:23:15
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hooge

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个老板应该拉出去XXX。当初。。。。算了,还是想办法赶紧毕业吧。
世界是分为你和他人两个方面的!
10楼2011-03-11 20:53:46
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