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qphll金虫 (正式写手)
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【分享】Lammps 安装, X64, PGI, MPICH, FFTW 已有2人参与
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需要认真尝试Lammps的REAX, 于是认真地在机器上面安装了一下新的版本, 22Nov10 (1) X64, PGI, 对应的FFTW和MPICH准备妥当; (2) lib下的reax, poems, meam, 分别make, 生成需要的lib文件; (3) # cd src # make yes-standard # make no-gpu # make no-USER-ATC (4) Makefile.pgi 文件内容, 注意MPICH和FFTW对应的版本!! # pgi = Portland Group compiler, pgCC, MPICH, FFTW SHELL = /bin/sh .SUFFIXES: .cpp .d # --------------------------------------------------------------------- # compiler/linker settings # specify flags and libraries needed for your compiler CC = mpicxx CCFLAGS = -fast DEPFLAGS = -M LINK = mpicxx LINKFLAGS = -Bstatic LIB = -lstdc++ -lpthread -lpgf90 -lpghpf_mpi -lpghpf2 -lpgf90rtl -lpgftnrtl ARCHIVE = ar ARFLAGS = -rc SIZE = size # --------------------------------------------------------------------- # LAMMPS-specific settings # specify settings for LAMMPS features you will use # LAMMPS ifdef options, see doc/Section_start.html LMP_INC = -DLAMMPS_GZIP -I/share/lhuang4/lammps-22Nov10/src/Obj_pgi -I../../lib/atc # MPI library, can be src/STUBS dummy lib # INC = path for mpi.h, MPI compiler settings # PATH = path for MPI library # LIB = name of MPI library MPI_INC = -I/usr/local/apps/mpich2/pgi105x64/1.3a2/include #MPI_PATH = -L/usr/local/apps/mpich2/pgi105x64/1.3a2/lib #MPI_LIB = -lmpich # FFT library, can be -DFFT_NONE if not using PPPM from KSPACE package # INC = -DFFT_FFTW, -DFFT_INTEL, -DFFT_NONE, etc, FFT compiler settings # PATH = path for FFT library # LIB = name of FFT library FFT_INC = -DFFT_FFTW -I/usr/local/apps/fftw/pgi105x64/2.1.5/include FFT_PATH = FFT_LIB = /usr/local/apps/fftw/pgi105x64/2.1.5/lib/libfftw.a # additional system libraries needed by LAMMPS package libraries # these settings are IGNORED if the corresponding LAMMPS package # (e.g. gpu, meam) is NOT included in the LAMMPS build # SYSLIB = names of libraries # SYSPATH = paths of libraries #gpu_SYSLIB = -lcudart meam_SYSLIB = -lpthread -lpgf90 -lpgc reax_SYSLIB = -lpthread -lpgf90 -lpgc user-atc_SYSLIB = -L/usr/local/apps/acml/acml4.3.0/pgi64/lib -lacml #gpu_SYSPATH = -L/usr/local/cuda/lib64 #meam_SYSPATH = /usr/local/pgi/linux86-64/10.5/lib #reax_SYSPATH = /usr/local/pgi/linux86-64/10.5/lib user-atc_SYSPATH = # --------------------------------------------------------------------- # build rules and dependencies # no need to edit this section include Makefile.package EXTRA_INC = $(LMP_INC) $(PKG_INC) $(MPI_INC) $(FFT_INC) EXTRA_PATH = $(PKG_PATH) $(MPI_PATH) $(FFT_PATH) $(PKG_SYSPATH) EXTRA_LIB = $(PKG_LIB) $(MPI_LIB) $(FFT_LIB) $(PKG_SYSLIB) # Link target $(EXE): $(OBJ) $(LINK) $(LINKFLAGS) $(EXTRA_PATH) $(OBJ) $(EXTRA_LIB) $(LIB) -o $(EXE) $(SIZE) $(EXE) # Library target lib: $(OBJ) $(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(EXE) $(OBJ) # Compilation rules %.o:%.cpp $(CC) $(CCFLAGS) $(EXTRA_INC) -c $< %.d:%.cpp $(CC) $(CCFLAGS) $(EXTRA_INC) $(DEPFLAGS) $< > $@ # Individual dependencies DEPENDS = $(OBJ:.o=.d) include $(DEPENDS) (6) # make pgi 生成可执行文件 lmp_pgi (7) 测试exmaple里面的reax文件, 并行计算, 测试通过. 仅供大家参考. |
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