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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】小分子扩散
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5858797

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】小分子扩散 已有5人参与

各位高手，小分子的扩散都可以研究那些性质，用那个模块好呢，我目前是用discover 优化，用forcite 分析，但只分析了MSD 和RDF，
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zxrhuanan

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风雨路上，有你帮忙
1楼 2010-11-23 10:04:24
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mountwar

禁虫 (小有名气)
★
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2楼2010-11-23 23:06:30
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石油黑人

银虫 (小有名气)
★ ★
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zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-11-24 08:22:11
倒是见过用discover跑动力学的，算扩散系数
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生活在白色恐怖之下，一样搞科研
3楼2010-11-24 08:18:20
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5858797

木虫 (正式写手)
★
sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-11-24 12:26:28
引用回帖:
Originally posted by mountwar at 2010-11-23 23:06:30:

楼主，我想问下，你测RDFs时，对原子进行设置时（set），你是如何操作的？谢谢。

就是设为两个set,小分子一个，管子上的某些原子设为一个set,你是做哪方面的？
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风雨路上，有你帮忙
4楼2010-11-24 08:25:05
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mountwar

禁虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
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5楼2010-11-24 12:14:58
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5858797

木虫 (正式写手)
★
cenwanglai(金币+1):谢谢回复！ 2010-11-24 21:00:33
引用回帖:
Originally posted by mountwar at 2010-11-24 12:14:58:

我是做药物分子与溶剂分子的相互作用关系的。就是怎么进行设置，选中原子后怎么对它进行设置，不是可以把它定义为A，B之类的吗，是如何操作的？

选中，点edit---set,---new 就可以了，关键是你的药物分子要选质心，最好就选中心的原子好了
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风雨路上，有你帮忙
6楼2010-11-24 19:13:33
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zxrhuanan

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵
(*^__^*) 嘻嘻……，我也在为select atom费神
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7楼2011-06-22 09:46:34
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rzhheart

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zxrhuanan at 2011-06-22 09:46:34:
(*^__^*) 嘻嘻……，我也在为select atom费神

进展快，不错呀~
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勤奋，求实，进取，奉献！
8楼2011-06-28 19:58:50
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