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【求助】有人会用XcrysDen给各个原子标上序号么?
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| 我用WIEN2k算ZnO摻Ni的超胞,到了计算DOS一步,我必须要知道我要算的那个原子在哪里,但是不会在XcrysDen上标出,我是个新手,请详细指教! |
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2楼2010-11-19 22:16:00
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你的回答很好,让我学了很重要的一招,还有什么快捷键,能否都告知?我的没有help文件,先谢谢你了 不过,我想表示原子顺序,在wien2k计算时生成的*.structnn文件里有第几个原子的编号,就是Zn、O、Ni后面的数字,下面是能否在XcrysDen中标上呢? Zn1 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -2 0.66667000 0.33333000 0.00105000 1 8 Zn2 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -3 0.16667000 0.33333000 0.19025000 2 8 -3 0.66667000 0.83333000 0.19025000 O 3 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -4 0.66667000 0.33333000 0.19025000 1 8 O 4 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -5 0.33333000 0.16667000 0.25105000 2 8 -5 0.83333000 0.66667000 0.25105000 Zn5 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -6 0.33333000 0.16667000 0.75105000 2 8 -6 0.83333000 0.66667000 0.75105000 Zn6 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -7 0.33333000 0.16667000 0.44025000 2 8 -7 0.83333000 0.66667000 0.44025000 O 7 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -8 0.83333000 0.16667000 0.25105000 1 8 Zn8 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -9 0.83333000 0.16667000 0.75105000 1 8 Zn9 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -10 0.83333000 0.16667000 0.44025000 1 8 O 10 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -11 0.16667000 0.83333000 0.00105000 1 8 Zn11 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -12 0.16667000 0.83333000 0.19025000 1 8 O 12 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -13 0.33333000 0.66667000 0.25105000 1 8 Zn13 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -14 0.33333000 0.66667000 0.75105000 1 8 Zn14 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -15 0.33333000 0.66667000 0.44025000 1 8 O 15 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -16 0.16667000 0.33333000 0.50105000 2 8 -16 0.66667000 0.83333000 0.50105000 Zn16 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -17 0.66667000 0.33333000 0.50105000 1 8 Zn17 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 30.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -18 0.16667000 0.33333000 0.69025000 2 8 -18 0.66667000 0.83333000 0.69025000 O 18 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -19 0.66667000 0.33333000 0.69025000 1 8 O 19 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -20 0.33333000 0.16667000 0.94025000 2 8 -20 0.83333000 0.66667000 0.94025000 O 20 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -21 0.83333000 0.16667000 0.94025000 1 8 O 21 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -22 0.16667000 0.83333000 0.50105000 1 8 Ni22 NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 1.9400 Z: 28.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -23 0.16667000 0.83333000 0.69025000 1 8 O 23 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 -24 0.33333000 0.66667000 0.94025000 1 8 O 24 NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 1.7200 Z: 8.0 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 |
3楼2010-11-20 17:41:29
4楼2010-11-21 13:19:49
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youzhizhe(金币+2):谢谢交流。 2010-12-05 22:47:09
youzhizhe(金币+2):谢谢交流。 2010-12-05 22:47:09
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我有一个办法可以实现你的要求,你进入xcrysden后,看左下角,点击atominfo的键,然后再去点相关原子,就可以看到这个原子的坐标,再去比对你的结构文件中的坐标就可以了。 还有一个办法,你如果想看某个坐标处的原子在什么位置,你可以把这个坐标处的原子如O,从Z=8变成Z=7,在从xcrysden上看的时候,这个O就变成N了,就可以很清晰的看到他在什么位置,然后在改过来就好啦。 不知道对你有没有帮助,祝好运,对啦,我对你们那种画PDOS的方法很好奇,可不可以详细的说明一下是怎么画的阿。谢谢 |
12楼2010-12-02 21:42:04
13楼2010-12-05 20:56:06
14楼2010-12-05 21:01:54
15楼2010-12-07 15:26:34
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