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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Wien2k&FLAPW&ELK » 【求助】有人会用XcrysDen给各个原子标上序号么？
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snowmami

新虫 (正式写手)

[交流] 【求助】有人会用XcrysDen给各个原子标上序号么？

我用WIEN2k算ZnO摻Ni的超胞，到了计算DOS一步，我必须要知道我要算的那个原子在哪里，但是不会在XcrysDen上标出，我是个新手，请详细指教！
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1楼 2010-11-19 09:38:02
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snowmami

新虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by gzqdyouxia at 2010-11-19 22:16:00:
按快捷键：s，会现实你的Ni原子的，不知道是不是你要的答案

你的回答很好，让我学了很重要的一招，还有什么快捷键，能否都告知？我的没有help文件，先谢谢你了
不过，我想表示原子顺序，在wien2k计算时生成的*.structnn文件里有第几个原子的编号，就是Zn、O、Ni后面的数字，下面是能否在XcrysDen中标上呢？
Zn1        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -2    0.66667000   0.33333000   0.00105000
                1                  8
Zn2        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -3    0.16667000   0.33333000   0.19025000
                2                  8
      -3    0.66667000   0.83333000   0.19025000
O 3        NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -4    0.66667000   0.33333000   0.19025000
                1                  8
O 4        NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -5    0.33333000   0.16667000   0.25105000
                2                  8
      -5    0.83333000   0.66667000   0.25105000
Zn5        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -6    0.33333000   0.16667000   0.75105000
                2                  8
      -6    0.83333000   0.66667000   0.75105000
Zn6        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -7    0.33333000   0.16667000   0.44025000
                2                  8
      -7    0.83333000   0.66667000   0.44025000
O 7        NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -8    0.83333000   0.16667000   0.25105000
                1                  8
Zn8        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -9    0.83333000   0.16667000   0.75105000
                1                  8
Zn9        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -10    0.83333000   0.16667000   0.44025000
                1                  8
O 10       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -11    0.16667000   0.83333000   0.00105000
                1                  8
Zn11       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -12    0.16667000   0.83333000   0.19025000
                1                  8
O 12       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -13    0.33333000   0.66667000   0.25105000
                1                  8
Zn13       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -14    0.33333000   0.66667000   0.75105000
                1                  8
Zn14       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -15    0.33333000   0.66667000   0.44025000
                1                  8
O 15       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -16    0.16667000   0.33333000   0.50105000
                2                  8
     -16    0.66667000   0.83333000   0.50105000
Zn16       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -17    0.66667000   0.33333000   0.50105000
                1                  8
Zn17       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -18    0.16667000   0.33333000   0.69025000
                2                  8
     -18    0.66667000   0.83333000   0.69025000
O 18       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -19    0.66667000   0.33333000   0.69025000
                1                  8
O 19       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -20    0.33333000   0.16667000   0.94025000
                2                  8
     -20    0.83333000   0.66667000   0.94025000
O 20       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -21    0.83333000   0.16667000   0.94025000
                1                  8
O 21       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -22    0.16667000   0.83333000   0.50105000
                1                  8
Ni22       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 28.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -23    0.16667000   0.83333000   0.69025000
                1                  8
O 23       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -24    0.33333000   0.66667000   0.94025000
                1                  8
O 24       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
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3楼2010-11-20 17:41:29
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gzqdyouxia

金虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-11-19 22:23:15
按快捷键：s，会现实你的Ni原子的，不知道是不是你要的答案
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2楼2010-11-19 22:16:00
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lan徉yang

铁虫 (初入文坛)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-11-21 15:08:35
引用回帖:
Originally posted by snowmami at 2010-11-20 17:41:29:

你的回答很好，让我学了很重要的一招，还有什么快捷键，能否都告知？我的没有help文件，先谢谢你了
不过，我想表示原子顺序，在wien2k计算时生成的*.structnn文件里有第几个原子的编号，就是Zn、O、Ni后面的数 ...

这个好像不能吧，我也不太清楚，我们计算的时候都是现根据你想要计算的那个原子的坐标大体上确认一下位置，然后再通过替代那个原子（换成别的原子后颜色不一样）来进一步确认，也不是很麻烦，呵呵，希望你能得到高手指点，我们也学学。
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4楼2010-11-21 13:19:49
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snowmami

新虫 (正式写手)
★
youzhizhe(金币+1):鼓励交流。 2010-12-03 01:31:00
引用回帖:
Originally posted by lan徉yang at 2010-11-21 13:19:49:

这个好像不能吧，我也不太清楚，我们计算的时候都是现根据你想要计算的那个原子的坐标大体上确认一下位置，然后再通过替代那个原子（换成别的原子后颜色不一样）来进一步确认，也不是很麻烦，呵呵，希望你能得到 ...

你说的是摻杂原子的计算，如果想得到Zn、O原子的PDOS不是要先选择好它的位置么，你一般是怎么选的呢？我是选一种和Ni原子编号接近的，另一种和Ni编号离得最远的，比如上面就选Zn1、O3和Zn17、O21这两种情况比较，看哪个更利于分析，就用哪个，不知这样对么，还请高手多多指教！
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5楼2010-11-21 15:41:13
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[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
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