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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Wien2k&FLAPW&ELK » 【求助】有人会用XcrysDen给各个原子标上序号么？
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snowmami

新虫 (正式写手)

[交流] 【求助】有人会用XcrysDen给各个原子标上序号么？

我用WIEN2k算ZnO摻Ni的超胞，到了计算DOS一步，我必须要知道我要算的那个原子在哪里，但是不会在XcrysDen上标出，我是个新手，请详细指教！
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1楼 2010-11-19 09:38:02
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lan徉yang

铁虫 (初入文坛)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-11-21 23:06:50
引用回帖:
Originally posted by snowmami at 2010-11-21 15:41:13:

你说的是摻杂原子的计算，如果想得到Zn、O原子的PDOS不是要先选择好它的位置么，你一般是怎么选的呢？我是选一种和Ni原子编号接近的，另一种和Ni编号离得最远的，比如上面就选Zn1、O3和Zn17、O21这两种情况比较 ...

你计算原子dos所用的方法和我们的差不多，都是选近邻和次近邻的，其他选择位置的方法，我们也是借鉴别人文献的。看来我们是同一条战线的战友，希望以后多多交流啊，呵呵。
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7楼2010-11-21 20:34:51
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gzqdyouxia

金虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-11-19 22:23:15
按快捷键：s，会现实你的Ni原子的，不知道是不是你要的答案
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2楼2010-11-19 22:16:00
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snowmami

新虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by gzqdyouxia at 2010-11-19 22:16:00:
按快捷键：s，会现实你的Ni原子的，不知道是不是你要的答案

你的回答很好，让我学了很重要的一招，还有什么快捷键，能否都告知？我的没有help文件，先谢谢你了
不过，我想表示原子顺序，在wien2k计算时生成的*.structnn文件里有第几个原子的编号，就是Zn、O、Ni后面的数字，下面是能否在XcrysDen中标上呢？
Zn1        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -2    0.66667000   0.33333000   0.00105000
                1                  8
Zn2        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -3    0.16667000   0.33333000   0.19025000
                2                  8
      -3    0.66667000   0.83333000   0.19025000
O 3        NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -4    0.66667000   0.33333000   0.19025000
                1                  8
O 4        NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -5    0.33333000   0.16667000   0.25105000
                2                  8
      -5    0.83333000   0.66667000   0.25105000
Zn5        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -6    0.33333000   0.16667000   0.75105000
                2                  8
      -6    0.83333000   0.66667000   0.75105000
Zn6        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -7    0.33333000   0.16667000   0.44025000
                2                  8
      -7    0.83333000   0.66667000   0.44025000
O 7        NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -8    0.83333000   0.16667000   0.25105000
                1                  8
Zn8        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
      -9    0.83333000   0.16667000   0.75105000
                1                  8
Zn9        NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -10    0.83333000   0.16667000   0.44025000
                1                  8
O 10       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -11    0.16667000   0.83333000   0.00105000
                1                  8
Zn11       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -12    0.16667000   0.83333000   0.19025000
                1                  8
O 12       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -13    0.33333000   0.66667000   0.25105000
                1                  8
Zn13       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -14    0.33333000   0.66667000   0.75105000
                1                  8
Zn14       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -15    0.33333000   0.66667000   0.44025000
                1                  8
O 15       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -16    0.16667000   0.33333000   0.50105000
                2                  8
     -16    0.66667000   0.83333000   0.50105000
Zn16       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -17    0.66667000   0.33333000   0.50105000
                1                  8
Zn17       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 30.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -18    0.16667000   0.33333000   0.69025000
                2                  8
     -18    0.66667000   0.83333000   0.69025000
O 18       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -19    0.66667000   0.33333000   0.69025000
                1                  8
O 19       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -20    0.33333000   0.16667000   0.94025000
                2                  8
     -20    0.83333000   0.66667000   0.94025000
O 20       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -21    0.83333000   0.16667000   0.94025000
                1                  8
O 21       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -22    0.16667000   0.83333000   0.50105000
                1                  8
Ni22       NPT=  781  R0=0.00005000 RMT=    1.9400   Z: 28.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -23    0.16667000   0.83333000   0.69025000
                1                  8
O 23       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
     -24    0.33333000   0.66667000   0.94025000
                1                  8
O 24       NPT=  781  R0=0.00010000 RMT=    1.7200   Z:  8.0
                     1.0000000 0.0000000 0.0000000
                     0.0000000 1.0000000 0.0000000
                     0.0000000 0.0000000 1.0000000
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3楼2010-11-20 17:41:29
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lan徉yang

铁虫 (初入文坛)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-11-21 15:08:35
引用回帖:
Originally posted by snowmami at 2010-11-20 17:41:29:

你的回答很好，让我学了很重要的一招，还有什么快捷键，能否都告知？我的没有help文件，先谢谢你了
不过，我想表示原子顺序，在wien2k计算时生成的*.structnn文件里有第几个原子的编号，就是Zn、O、Ni后面的数 ...

这个好像不能吧，我也不太清楚，我们计算的时候都是现根据你想要计算的那个原子的坐标大体上确认一下位置，然后再通过替代那个原子（换成别的原子后颜色不一样）来进一步确认，也不是很麻烦，呵呵，希望你能得到高手指点，我们也学学。
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4楼2010-11-21 13:19:49
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[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
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