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【求助】PDB文件在Gview中的显示问题
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sunzhiguo
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[交流]
【求助】PDB文件在Gview中的显示问题
在MS中截取分子筛簇模型,自动加氢原子,存为PDB 文件。在Gview打开,发现所加的氢原子与簇模型氧原子之间没有键,成游离状态,请问大家什么原因,怎么解决?多谢指教。
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1楼
2010-11-18 11:06:12
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zhou2009(金币+1): 2010-11-18 11:23:42
有关的键长超过了GaussView的判据。手动建立连接即可。
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2楼
2010-11-18 11:11:57
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sunzhiguo
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引用回帖:
Originally posted by
ykwang
at 2010-11-18 11:11:57:
有关的键长超过了GaussView的判据。手动建立连接即可。
多谢指导。那么请问手动连接时方向有没有限制,绝大多数文献说使氢氧键顺着硅氧键方向,该怎么操作呢?恳请赐教。
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3楼
2010-11-18 13:55:31
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引用回帖:
Originally posted by
sunzhiguo
at 2010-11-18 13:55:31:
多谢指导。那么请问手动连接时方向有没有限制,绝大多数文献说使氢氧键顺着硅氧键方向,该怎么操作呢?恳请赐教。
我没有见过这种说法。如果可能你把PDB文件贴上来,可以帮你分析一下。
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4楼
2010-11-18 14:41:56
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