登录注册

24小时热门版块排行榜

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】PDB文件在Gview中的显示问题

在MS中截取分子筛簇模型，自动加氢原子，存为PDB 文件。在Gview打开，发现所加的氢原子与簇模型氧原子之间没有键，成游离状态，请问大家什么原因，怎么解决？多谢指教。

1楼 2010-11-18 11:06:12

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

金虫 (正式写手)

★
zhou2009(金币+1): 2010-11-18 11:23:42

有关的键长超过了GaussView的判据。手动建立连接即可。

2楼2010-11-18 11:11:57

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

金虫 (正式写手)

引用回帖:

Originally posted by ykwang at 2010-11-18 11:11:57:
有关的键长超过了GaussView的判据。手动建立连接即可。

多谢指导。那么请问手动连接时方向有没有限制，绝大多数文献说使氢氧键顺着硅氧键方向，该怎么操作呢？恳请赐教。

3楼2010-11-18 13:55:31

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

金虫 (正式写手)

引用回帖:

Originally posted by sunzhiguo at 2010-11-18 13:55:31:
多谢指导。那么请问手动连接时方向有没有限制，绝大多数文献说使氢氧键顺着硅氧键方向，该怎么操作呢？恳请赐教。

我没有见过这种说法。如果可能你把PDB文件贴上来，可以帮你分析一下。

4楼2010-11-18 14:41:56

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主 sunzhiguo 的主题更新