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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » CPMD/CP2K » 【求助】md跑几百步之后out文件出现NaN（无报错）
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xk6891

实习版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[交流] 【求助】md跑几百步之后out文件出现NaN（无报错）

做了一个周期性的模拟，一直困扰我的问题，wavefunction optimize与geometry optimize都做了，而且都收敛了，为了实验收敛条件降低了两三个数量级，为什么跑md时，跑了200，300步之后总是出现NaN的字样，这大概是什么问题，NaN代表什么？？
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1楼 2010-11-12 10:51:12
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hooge

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
xk6891(金币+1): 2010-11-22 10:57:33
zh1987hs(金币+1):谢谢交流 2010-11-22 14:31:29
引用回帖:
Originally posted by xk6891 at 2010-11-21 15:23:47:

用的是PARRINELLO－RAHMAN的关键词，msst冲击加载。找到下面对应的是NPT的系综，是因为温度没有设定。但是这个温度的设定不能设为一个定值吧，应该定一个初始温度，这样想对么？？

系综的意思就是调整外界条件阿，所以压力和温度都需要设定的，除非你用nve系综（等能量），不用调整，温度升高是一定的。但是npt温度不变的，否则不符号统计系综阿。PR好像是调节压力的吧。
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9楼2010-11-22 08:33:05
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coolrainbow

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★ ★ ★
xk6891(金币+1):谢谢参与
xk6891(金币+2):谢谢专家，哈哈，能给列出一些可能出问题项目么 2010-11-12 18:37:07
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-13 12:06:05
NaN是IEEE中非数的意思，表明体系的能量过高或者某些设置不合理
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2楼2010-11-12 17:38:41
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baoer3808

管理员

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
xk6891(金币+1):谢谢参与
我也遇到的是这个问题
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3楼2010-11-19 09:46:27
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xk6891

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
★
zh1987hs(金币+1):鼓励交流 2010-11-19 13:54:45
引用回帖:
Originally posted by baoer3808 at 2010-11-19 09:46:27:
我也遇到的是这个问题

个人感觉还是优化做的不好或者md的输入文件写的不合理，现在我的已经不NaN了～～但是结果还是不合理
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4楼2010-11-19 12:59:14
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