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xk6891

至尊木虫 (著名写手)

模拟EPI: 1
应助: 0 (幼儿园)
金币: 13735.8
帖子: 1514
在线: 546小时
虫号: 890342

[交流] 【求助】md跑几百步之后out文件出现NaN（无报错）

做了一个周期性的模拟，一直困扰我的问题，wavefunction optimize与geometry optimize都做了，而且都收敛了，为了实验收敛条件降低了两三个数量级，为什么跑md时，跑了200，300步之后总是出现NaN的字样，这大概是什么问题，NaN代表什么？？

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1楼 2010-11-12 10:51:12

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

hooge

木虫 (正式写手)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 1790.1
帖子: 975
在线: 135.1小时
虫号: 89636

★
xk6891(金币+1): 2010-11-22 10:57:33
zh1987hs(金币+1):谢谢交流 2010-11-22 14:31:29

引用回帖:

Originally posted by xk6891 at 2010-11-21 15:23:47:

用的是PARRINELLO－RAHMAN的关键词，msst冲击加载。找到下面对应的是NPT的系综，是因为温度没有设定。但是这个温度的设定不能设为一个定值吧，应该定一个初始温度，这样想对么？？

系综的意思就是调整外界条件阿，所以压力和温度都需要设定的，除非你用nve系综（等能量），不用调整，温度升高是一定的。但是npt温度不变的，否则不符号统计系综阿。PR好像是调节压力的吧。