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【求助】md跑几百步之后out文件出现NaN(无报错)
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xk6891
至尊木虫
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[交流]
【求助】md跑几百步之后out文件出现NaN(无报错)
做了一个周期性的模拟,一直困扰我的问题,wavefunction optimize与geometry optimize都做了,而且都收敛了,为了实验收敛条件降低了两三个数量级,为什么跑md时,跑了200,300步之后总是出现NaN的字样,这大概是什么问题,NaN代表什么??
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2010-11-12 10:51:12
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hooge
木虫
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★
xk6891(金币+1): 2010-11-22 10:57:33
zh1987hs(金币+1):谢谢交流 2010-11-22 14:31:29
引用回帖:
Originally posted by
xk6891
at 2010-11-21 15:23:47:
用的是PARRINELLO-RAHMAN的关键词,msst冲击加载。找到下面对应的是NPT的系综,是因为温度没有设定。但是这个温度的设定不能设为一个定值吧,应该定一个初始温度,这样想对么??
系综的意思就是调整外界条件阿,所以压力和温度都需要设定的,除非你用nve系综(等能量),不用调整,温度升高是一定的。但是npt温度不变的,否则不符号统计系综阿。PR好像是调节压力的吧。
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9楼
2010-11-22 08:33:05
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coolrainbow
木虫
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★ ★ ★
xk6891(金币
+1
):谢谢参与
xk6891(金币+2):谢谢专家,哈哈,能给列出一些可能出问题项目么 2010-11-12 18:37:07
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-13 12:06:05
NaN是IEEE中非数的意思,表明体系的能量过高或者某些设置不合理
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2楼
2010-11-12 17:38:41
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baoer3808
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★
xk6891(金币
+1
):谢谢参与
我也遇到的是这个问题
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3楼
2010-11-19 09:46:27
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xk6891
至尊木虫
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★
zh1987hs(金币+1):鼓励交流 2010-11-19 13:54:45
引用回帖:
Originally posted by
baoer3808
at 2010-11-19 09:46:27:
我也遇到的是这个问题
个人感觉还是优化做的不好或者md的输入文件写的不合理,现在我的已经不NaN了~~但是结果还是不合理
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4楼
2010-11-19 12:59:14
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