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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】按论坛方法安装Gaussian09出错 已有7人参与

我按照论坛上http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
安装g09,具体如下:
1)解压缩g09_linux.tar到/home/wang/下
2)cd g09
3)./bsd/install    #一闪就过了
4)修改.bashrc如下

### Gaussian Configuration   ###
export g09root=/home/wang/
export GAUSS_SCRDIR=/home/wang/scr    #提前建立了scr文件夹
source $g09root/g09/bsd/g09.login                                 
[wang@nano ~]$ source .bashrc
-bash: /home/bjwang//g09/bsd/g09.login: line 25: syntax error near unexpected token `setenv'
-bash: /home/bjwang//g09/bsd/g09.login: line 25: `if (! $?PGI ) setenv PGI /usr/pgi'
出现错误!!!!!!

我又把上面的source $g09root/g09/bsd/g09.login
变为source $g09root/g09/bsd/g09.profile,
source .bashrc成功,
但执行[wang@nano ~]$ g09
Entering Gaussian System, Link 0=g09

我又按网上其他同学的帖子把.bashrc修改为
g09root=/home/wang/
GAUSS_SCRDIR=/home/wang/scr
PATH=$PATH:/home/wang
export g09root GAUSS_SCRDIR
source $g09root/g09/bsd/g09.profile

source  .bashrc没有出错!
但执行[wang@nano ~]$ g09   
Entering Gaussian System, Link 0=g09
错误依旧
没反应了!!!!!!!!!!
最后说明:我是通过SSH访问CentOS服务器安装g09的。
哪位同学帮忙看看错在哪里,兄弟是刚接触这块,谢谢!!!!

[ Last edited by bjwang on 2010-11-11 at 19:24 ]
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):鼓励交流!! 2010-11-11 20:16:26
[wang@nano ~]$ source .bashrc
-bash: /home/bjwang//g09/bsd/g09.login: line 25: syntax error near unexpected token `setenv'
-bash: /home/bjwang//g09/bsd/g09.login: line 25: `if (! $?PGI ) setenv PGI /usr/pgi'
出现错误!!!!!!
g09root=/home/wang/
删掉最后一个/试一试
前途光明,出路难觅!
2楼2010-11-11 19:24:02
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

谢谢老兄的回复,我把上面的source $g09root/g09/bsd/g09.login
变为source $g09root/g09/bsd/g09.profile,
source .bashrc成功,
我把g09root=/home/wang/删掉最后一个/还是可以source成功的,但如果不改上面的login的话还不行。
但执行[wang@nano ~]$ g09   
Entering Gaussian System, Link 0=g09
错误依旧
没反应了!!!!!!!!!!

[ Last edited by bjwang on 2010-11-11 at 19:32 ]
It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
3楼2010-11-11 19:30:42
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calfwoo

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
但执行[wang@nano ~]$ g09   
Entering Gaussian System, Link 0=g09

这样有问题吗?

做好输入文件,直接 $g09 input.gjf output.out就行了.

你只敲入g09,程序在等你输入"输入文件"呢吧.
4楼2010-11-11 21:03:01
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

引用回帖:
Originally posted by calfwoo at 2010-11-11 21:03:01:


这样有问题吗?

做好输入文件,直接 $g09 input.gjf output.out就行了.

你只敲入g09,程序在等你输入"输入文件"呢吧.

已经有高人指导你了。
前途光明,出路难觅!
5楼2010-11-11 21:47:53
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

谢谢上面两位老兄,我输入g09 /home/abc/g09/tests/com/test000.com out &
在本文件夹下得到out.log 是意味着运行成功了? 我就是想先测试一下g09是否安装成功。路漫漫其修远兮,以后还要多麻烦各位呢,再次感谢!
      另附一个问题:论坛上强调的“高斯说明书”,就是Gaussian 09 User’s Refrence吗?与G09 IOps Reference有啥区别和联系?在网上只找到在线的,pdf的下载都失效了,哪位能传一份,谢谢。2010bjwang@tongji.edu.cn

[ Last edited by bjwang on 2010-11-12 at 09:19 ]
It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
6楼2010-11-12 09:02:41
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xiaowandouer

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不知道楼主成功了没有

貌似要改下g09.profile & g09.login

试试这个方法

(1)在g09.profile 中指定 GAUSS_SCRDIR的路径, GAUSS_SCRDIR=/???(具体路径)
然后再加入
Export g09root GAUSS_SCRDIR
. $g09root/g09/bsd/g09.profile

(2)在g09.login中加入
setenv GAUSS_SCRDIR=/????
source $gr/g09/g09.login


另外,之前有装过其他版本的话,要卸载干净
7楼2010-11-12 10:05:42
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

谢谢各位兄弟的热情帮忙,好像可以了,没有改g09.profile & g09.login;
总结一下
在.bashrc中加入:
### Gaussian Configuration   ###
export g09root=/home/wang/
export GAUSS_SCRDIR=/home/wang/scr    #提前建立了scr文件夹
source $g09root/g09/bsd/g09.profile  

source .bashrc后

执行 g09 /home/abc/g09/tests/com/test000.com out &
产生out.log
It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
8楼2010-11-12 13:41:49
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寒雨人生

铁杆木虫 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by bjwang at 2010-11-11 19:06:08:
我按照论坛上http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
安装g09,具体如下:
1)解压缩g09_linux.tar到/home/wang/下
2)cd g09
3)./bsd/install    #一闪就过了
4)修改.bashrc如下
...

我用的是fedora12,按楼主写的安装之后 g09 /home/abc/g09/tests/com/test000.com out &
结果给出bash: /home/abc//g09/g09: cannot execute binary file……
这又是为什么阿?
9楼2011-05-04 22:55:59
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by 寒雨人生 at 2011-05-04 22:55:59:
我用的是fedora12,按楼主写的安装之后 g09 /home/abc/g09/tests/com/test000.com out &
结果给出bash: /home/abc//g09/g09: cannot execute binary file……
这又是为什么阿?

猜测一下,你的系统是32位的,而G09是64位的。

如果不是上面的原因的话,那就是你的文件权限设置不正确。
10楼2011-05-05 00:25:46
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