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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】按论坛方法安装Gaussian09出错
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】按论坛方法安装Gaussian09出错 已有7人参与

我按照论坛上http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
安装g09，具体如下：
1）解压缩g09_linux.tar到/home/wang/下
2）cd g09
3）./bsd/install    #一闪就过了
4）修改.bashrc如下

### Gaussian Configuration   ###
export g09root=/home/wang/
export GAUSS_SCRDIR=/home/wang/scr    #提前建立了scr文件夹
source $g09root/g09/bsd/g09.login                                 
[wang@nano ~]$ source .bashrc
-bash: /home/bjwang//g09/bsd/g09.login: line 25: syntax error near unexpected token `setenv'
-bash: /home/bjwang//g09/bsd/g09.login: line 25: `if (! $?PGI ) setenv PGI /usr/pgi'
出现错误！！！！！！

我又把上面的source $g09root/g09/bsd/g09.login
变为source $g09root/g09/bsd/g09.profile，
source .bashrc成功,
但执行[wang@nano ~]$ g09
Entering Gaussian System, Link 0=g09

我又按网上其他同学的帖子把.bashrc修改为
g09root=/home/wang/
GAUSS_SCRDIR=/home/wang/scr
PATH=$PATH:/home/wang
export g09root GAUSS_SCRDIR
source $g09root/g09/bsd/g09.profile

source  .bashrc没有出错！
但执行[wang@nano ~]$ g09   
Entering Gaussian System, Link 0=g09
错误依旧
没反应了！！！！！！！！！！
最后说明：我是通过SSH访问CentOS服务器安装g09的。
哪位同学帮忙看看错在哪里，兄弟是刚接触这块，谢谢！！！！

[ Last edited by bjwang on 2010-11-11 at 19:24 ]
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
1楼 2010-11-11 19:06:08
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-11-11 20:16:26
[wang@nano ~]$ source .bashrc
-bash: /home/bjwang//g09/bsd/g09.login: line 25: syntax error near unexpected token `setenv'
-bash: /home/bjwang//g09/bsd/g09.login: line 25: `if (! $?PGI ) setenv PGI /usr/pgi'
出现错误！！！！！！
g09root=/home/wang/
删掉最后一个/试一试
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前途光明，出路难觅！
2楼2010-11-11 19:24:02
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
谢谢老兄的回复，我把上面的source $g09root/g09/bsd/g09.login
变为source $g09root/g09/bsd/g09.profile，
source .bashrc成功,
我把g09root=/home/wang/删掉最后一个/还是可以source成功的，但如果不改上面的login的话还不行。
但执行[wang@nano ~]$ g09   
Entering Gaussian System, Link 0=g09
错误依旧
没反应了！！！！！！！！！！

[ Last edited by bjwang on 2010-11-11 at 19:32 ]
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
3楼2010-11-11 19:30:42
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calfwoo

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
但执行[wang@nano ~]$ g09   
Entering Gaussian System, Link 0=g09

这样有问题吗？

做好输入文件，直接 $g09 input.gjf output.out就行了．

你只敲入g09，程序在等你输入＂输入文件＂呢吧．
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-11-11 21:03:01
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
引用回帖:
Originally posted by calfwoo at 2010-11-11 21:03:01:


这样有问题吗？

做好输入文件，直接 $g09 input.gjf output.out就行了．

你只敲入g09，程序在等你输入＂输入文件＂呢吧．

已经有高人指导你了。
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前途光明，出路难觅！
5楼2010-11-11 21:47:53
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
谢谢上面两位老兄，我输入g09 /home/abc/g09/tests/com/test000.com out &
在本文件夹下得到out.log 是意味着运行成功了？ 我就是想先测试一下g09是否安装成功。路漫漫其修远兮，以后还要多麻烦各位呢，再次感谢！
      另附一个问题：论坛上强调的“高斯说明书”，就是Gaussian 09 User’s Refrence吗？与G09 IOps Reference有啥区别和联系？在网上只找到在线的，pdf的下载都失效了，哪位能传一份，谢谢。2010bjwang@tongji.edu.cn

[ Last edited by bjwang on 2010-11-12 at 09:19 ]
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
6楼2010-11-12 09:02:41
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xiaowandouer

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
不知道楼主成功了没有

貌似要改下g09.profile & g09.login

试试这个方法

（1）在g09.profile 中指定 GAUSS_SCRDIR的路径， GAUSS_SCRDIR=/？？？(具体路径）
然后再加入
Export g09root GAUSS_SCRDIR
. $g09root/g09/bsd/g09.profile

（2）在g09.login中加入
setenv GAUSS_SCRDIR=/????
source $gr/g09/g09.login


另外，之前有装过其他版本的话，要卸载干净
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7楼2010-11-12 10:05:42
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
谢谢各位兄弟的热情帮忙，好像可以了，没有改g09.profile & g09.login；
总结一下
在.bashrc中加入：
### Gaussian Configuration   ###
export g09root=/home/wang/
export GAUSS_SCRDIR=/home/wang/scr    #提前建立了scr文件夹
source $g09root/g09/bsd/g09.profile  

source .bashrc后

执行 g09 /home/abc/g09/tests/com/test000.com out &
产生out.log
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
8楼2010-11-12 13:41:49
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寒雨人生

铁杆木虫 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by bjwang at 2010-11-11 19:06:08:
我按照论坛上http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
安装g09，具体如下：
1）解压缩g09_linux.tar到/home/wang/下
2）cd g09
3）./bsd/install    #一闪就过了
4）修改.bashrc如下
...

我用的是fedora12，按楼主写的安装之后 g09 /home/abc/g09/tests/com/test000.com out &
结果给出bash: /home/abc//g09/g09: cannot execute binary file……
这又是为什么阿？
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9楼2011-05-04 22:55:59
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by 寒雨人生 at 2011-05-04 22:55:59:
我用的是fedora12，按楼主写的安装之后 g09 /home/abc/g09/tests/com/test000.com out &
结果给出bash: /home/abc//g09/g09: cannot execute binary file……
这又是为什么阿？

猜测一下，你的系统是32位的，而G09是64位的。

如果不是上面的原因的话，那就是你的文件权限设置不正确。
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10楼2011-05-05 00:25:46
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