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hliu

银虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 904.1
帖子: 33
在线: 90.8小时
虫号: 182200

[交流] 【求助】NBO输出求助

如下所示的NBO输出文件中，σ*(N2-H1)轨道电子密度指哪一部分，文献上为0.02462 e

NAO  Atom  No  lang Type(AO) Occupancy    Energy
------
   1 H 1  S    Val( 1S)    0.67810    0.13543
   2 H 1  S    Ryd( 2S)    0.00281    0.70145
   3 H 1  px    Ryd( 2p)    0.00147    3.16277
   4 H 1  py    Ryd( 2p)    0.00030    2.58716
   5 H 1  pz    Ryd( 2p)    0.00012    2.45936
   6 N 2  S    Cor( 1S)    1.99985    -15.59160
   7 N 2  S    Val( 2S)    1.58072    -0.81976
   8 N 2  S    Ryd( 3S)    0.01144    1.17427
   9 N 2  S    Ryd( 4S)    0.00007    3.86883
10 N 2  px    Val( 2p)    1.52735    -0.32644
11 N 2  px    Ryd( 3p)    0.00439    0.99676
12 N 2  py    Val( 2p)    1.06159    -0.17443
13 N 2  py    Ryd( 3p)    0.01195    0.85110
14 N 2  pz    Val( 2p)    0.80869    -0.15830
15 N 2  pz    Ryd( 3p)    0.00111    0.89786
16 N 2  dxy Ryd( 3d)    0.00309    2.46203
17 N 2  dxz Ryd( 3d)    0.00038    2.07147
18 N 2  dyz Ryd( 3d)    0.00479    2.26105
19 N 2  dx2y2  Ryd( 3d)    0.00388    2.77616
20 N 2  dz2 Ryd( 3d)    0.00161    2.44932
21 O 3  S    Cor( 1S)    1.99987    -20.47250
22 O 3  S    Val( 2S)    1.76025    -1.19914
23 O 3  S    Ryd( 3S)    0.00613    1.36895
24 O 3  S    Ryd( 4S)    0.00003    3.65112
25 O 3  px    Val( 2p)    1.96805    -0.54256
26 O 3  px    Ryd( 3p)    0.00394    1.18999
27 O 3  py    Val( 2p)    1.36692    -0.36083
28 O 3  py    Ryd( 3p)    0.00133    1.29615
29 O 3  pz    Val( 2p)    1.17949    -0.28886
30 O 3  pz    Ryd( 3p)    0.00032    1.20406
31 O 3  dxy Ryd( 3d)    0.00215    2.38178
32 O 3  dxz Ryd( 3d)    0.00002    2.06447
33 O 3  dyz Ryd( 3d)    0.00509    2.32815
34 O 3  dx2y2  Ryd( 3d)    0.00216    2.77876
35 O 3  dz2 Ryd( 3d)    0.00055    2.30563

Summary of Natural Population Analysis:

                                    Natural Population
            Natural  -----------------------------------------------
Atom  No Charge       Core    Valence Rydberg    Total
-----------------------------------------------------------------------
   H 1 0.31721    0.00000    0.67810 0.00469    0.68279
   N 2 -0.02092    1.99985    4.97834 0.04272    7.02092
   O 3 -0.29629    1.99987    6.27471 0.02171    8.29629

* Total * 0.00000    3.99973 11.93115 0.06912 16.00000

                              Natural Population
--------------------------------------------------------
-

Atom  No       Natural Electron Configuration
--------------------------------
   H 1          1S( 0.68)
   N 2    [core]2S( 1.58)2p( 3.40)3S( 0.01)3p( 0.02)3d( 0.01)
   O 3    [core]2S( 1.76)2p( 4.51)3S( 0.01)3p( 0.01)3d( 0.01)

NATURAL BOND ORBITAL ANALYSIS:

                     Occupancies    Lewis Structure Low High
         Occ. -------------------  ----------------- occ occ
  Cycle Thresh. Lewis Non-Lewis    CR  BD  3C  LP (L) (NL) Dev
===============
1(1) 1.90 15.95466 0.04534    2 3 0 3    0    0 0.04
-----------------------------------------------------------------------------
Structure accepted: No low occupancy Lewis orbitals
--------------------------------------------------------
Core                   3.99973 ( 99.993% of 4)
Valence Lewis          11.95493 ( 99.624% of  12)
  ==

   (Occupancy) Bond orbital/ Coefficients/ Hybrids
----------
   1. (1.99513) BD ( 1) H 1 - N 2
            ( 33.20%) 0.5762* H 1 s( 99.78%)p 0.00(  0.22%)
                                          0.9989 -0.0096  0.0442 -0.0140  0.0000
            ( 66.80%) 0.8173* N 2 s( 21.88%)p 3.56( 77.92%)d 0.01(  0.20%)
                                          0.0000  0.4677 -0.0055  0.0050 -0.8393
                                          0.0116  0.2714  0.0308  0.0000  0.0000
                                       -0.0080  0.0000  0.0000  0.0381 -0.0211
   2. (1.99988) BD ( 1) N 2 - O 3
            ( 40.75%) 0.6384* N 2 s(  0.00%)p 1.00( 99.37%)d 0.01(  0.63%)
                                          0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000
                                          0.0000  0.0000  0.0000  0.9961 -0.0369
                                          0.0000 -0.0215 -0.0767  0.0000  0.0000
            ( 59.25%) 0.7697* O 3 s(  0.00%)p 1.00( 99.57%)d 0.00(  0.43%)
                                          0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000
                                          0.0000  0.0000  0.0000  0.9977  0.0164
                                          0.0000 -0.0044  0.0655  0.0000  0.0000
   3. (1.99845) BD ( 2) N 2 - O 3
            ( 42.86%) 0.6547* N 2 s( 26.46%)p 2.77( 73.20%)d 0.01(  0.34%)
                                       -0.0001 -0.5055  0.0952  0.0005 -0.0026
                                       -0.0247  0.8497  0.0970  0.0000  0.0000
                                       -0.0146  0.0000  0.0000  0.0496  0.0264
            ( 57.14%) 0.7559* O 3 s( 27.74%)p 2.60( 72.05%)d 0.01(  0.21%)
                                          0.0000 -0.5229  0.0631 -0.0003  0.0031
                                       -0.0007 -0.8483  0.0308  0.0000  0.0000
                                          0.0047  0.0000  0.0000  0.0401  0.0207
   4. (1.99985) CR ( 1) N 2          s(100.00%)
                                          1.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000
                                          0.0000  0.0001  0.0000  0.0000  0.0000
                                          0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000
   5. (1.99987) CR ( 1) O 3          s(100.00%)p 0.00(  0.00%)
                                          1.0000  0.0002  0.0000  0.0000  0.0001
                                          0.0000 -0.0001  0.0000  0.0000  0.0000
                                          0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000
   6. (1.99775) LP ( 1) N 2          s( 52.39%)p 0.91( 47.58%)d 0.00(  0.03%)
                                          0.0000  0.7231  0.0320 -0.0020  0.5401
                                       -0.0268  0.4282 -0.0102  0.0000  0.0000
                                       -0.0125  0.0000  0.0000 -0.0025  0.0128
   7. (1.99582) LP ( 1) O 3          s( 67.33%)p 0.48( 32.65%)d 0.00(  0.02%)
                                       -0.0002  0.8202  0.0228 -0.0002 -0.2691
                                       -0.0039 -0.5040  0.0078  0.0000  0.0000
                                       -0.0067  0.0000  0.0000  0.0111  0.0037
   8. (1.96791) LP ( 2) O 3          s(  5.33%)p17.74( 94.59%)d 0.01(  0.08%)
                                       -0.0001  0.2309 -0.0002  0.0000  0.9626
                                          0.0085 -0.1385 -0.0006  0.0000  0.0000
                                          0.0278  0.0000  0.0000  0.0017  0.0022
   9. (0.00293) RY*( 1) H 1          s( 97.82%)p 0.02(  2.18%)
                                          0.0079  0.9890  0.0762  0.1265  0.0000
10. (0.00020) RY*( 2) H 1          s(  2.19%)p44.62( 97.81%)
                                          0.0117  0.1476 -0.5016 -0.8523  0.0000
11. (0.00012) RY*( 3) H 1          s(  0.00%)p 1.00(100.00%)
                                          0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.0000
12. (0.00001) RY*( 4) H 1          s(  0.20%)p99.99( 99.80%)
13. (0.00577) RY*( 1) N 2          s( 17.50%)p 2.29( 40.11%)d 2.42( 42.39%)
                                          0.0000  0.0149  0.4181  0.0065 -0.0269
                                       -0.6312 -0.0449  0.0047  0.0000  0.0000
                                          0.6476  0.0000  0.0000 -0.0424  0.0511
14. (0.00369) RY*( 2) N 2          s( 14.93%)p 5.28( 78.83%)d 0.42(  6.25%)
                                          0.0000  0.0488  0.3724  0.0906  0.0220
                                          0.0358 -0.1229  0.8783  0.0000  0.0000
                                       -0.2227  0.0000  0.0000  0.0798  0.0807
   33. (0.02568) BD*( 1) H 1 - N 2
            ( 66.80%) 0.8173* H 1 s( 99.78%)p 0.00(  0.22%)
                                          0.9989 -0.0096  0.0442 -0.0140  0.0000
            ( 33.20%)  -0.5762* N 2 s( 21.88%)p 3.56( 77.92%)d 0.01(  0.20%)
                                          0.0000  0.4677 -0.0055  0.0050 -0.8393
                                          0.0116  0.2714  0.0308  0.0000  0.0000
                                       -0.0080  0.0000  0.0000  0.0381 -0.0211
34. (0.00000) BD*( 1) N 2 - O 3
            ( 59.25%) 0.7697* N 2 s(  0.00%)p 1.00( 99.37%)d 0.01(  0.63%)
            ( 40.75%)  -0.6384* O 3 s(  0.00%)p 1.00( 99.57%)d 0.00(  0.43%)
35. (0.00176) BD*( 2) N 2 - O 3
            ( 57.14%) 0.7559* N 2 s( 26.46%)p 2.77( 73.20%)d 0.01(  0.34%)
                                       -0.0001 -0.5055  0.0952  0.0005 -0.0026
                                       -0.0247  0.8497  0.0970  0.0000  0.0000
                                       -0.0146  0.0000  0.0000  0.0496  0.0264
            ( 42.86%)  -0.6547* O 3 s( 27.74%)p 2.60( 72.05%)d 0.01(  0.21%)
                                          0.0000 -0.5229  0.0631 -0.0003  0.0031
                                       -0.0007 -0.8483  0.0308  0.0000  0.0000
                                          0.0047  0.0000  0.0000  0.0401  0.0207

NHO Directionality and "Bond Bending" (deviations from line of nuclear centers)

                                 Line of Centers       Hybrid 1             Hybrid 2
                           ---------------  ------------------- ------------------
            NBO             Theta Phi Theta Phi Dev Theta Phi Dev
====
1. BD ( 1) H 1 - N 2 90.0  342.8    --    -- --    90.0  159.9 2.9
2. BD ( 1) N 2 - O 3 90.0  270.0    0.0 0.0  90.0    0.0 0.0  90.0
3. BD ( 2) N 2 - O 3 90.0  270.0 90.0  271.7 1.7    --    -- --
6. LP ( 1) N 2          --    --    90.0 39.2 --    --    -- --
7. LP ( 1) O 3          --    --    90.0  241.2 --    --    -- --
8. LP ( 2) O 3          --    --    90.0  351.8 --    --    -- --
Second Order Perturbation Theory Analysis of Fock Matrix in NBO Basis

   Threshold for printing: 0.50 kcal/mol
                                                                           E(2)  E(j)-E(i) F(i,j)
      Donor NBO (i)                   Acceptor NBO (j)                kcal/mol a.u. a.u.
==
within unit  1
1. BD ( 1) H 1 - N 2       / 23. RY*( 1) O 3                   3.23 2.19 0.075
1. BD ( 1) H 1 - N 2       / 35. BD*( 2) N 2 - O 3          1.70 1.63 0.047
4. CR ( 1) N 2             / 24. RY*( 2) O 3                   0.62 17.47 0.093
5. CR ( 1) O 3             / 14. RY*( 2) N 2                   2.84 21.47 0.221
6. LP ( 1) N 2             / 23. RY*( 1) O 3                   2.08 2.08 0.059
7. LP ( 1) O 3             / 13. RY*( 1) N 2                   1.10 2.63 0.048
7. LP ( 1) O 3             / 14. RY*( 2) N 2                   4.59 2.06 0.087
8. LP ( 2) O 3             / 13. RY*( 1) N 2                   5.32 2.14 0.096
8. LP ( 2) O 3             / 14. RY*( 2) N 2                   1.54 1.57 0.044
8. LP ( 2) O 3             / 18. RY*( 6) N 2                   0.52 2.35 0.031
8. LP ( 2) O 3             / 33. BD*( 1) H 1 - N 2          15.12 1.23 0.122

Natural Bond Orbitals (Summary):
                                                         Principal Delocalizations
         NBO                      Occupancy Energy (geminal,vicinal,remote)
==
Molecular unit  1  (HNO)
1. BD ( 1) H 1 - N 2       1.99513 -0.86619  23(v),35(g)
2. BD ( 1) N 2 - O 3       1.99988 -0.57728
3. BD ( 2) N 2 - O 3       1.99845 -1.34232
4. CR ( 1) N 2                1.99985 -15.59152  24(v)
5. CR ( 1) O 3                1.99987 -20.47307  14(v)
6. LP ( 1) N 2                1.99775 -0.74825  23(v)
7. LP ( 1) O 3                1.99582 -1.06574  14(v),13(v)
8. LP ( 2) O 3                1.96791 -0.58139  33(v),13(v),14(v),18(v)
9. RY*( 1) H 1                0.00293    0.72937
  10. RY*( 2) H 1                0.00020    2.52712
  11. RY*( 3) H 1                0.00012    2.45936
  12. RY*( 4) H 1                0.00001    3.17403
  13. RY*( 1) N 2                0.00577    1.56193
  14. RY*( 2) N 2                0.00369    0.99346
  15. RY*( 3) N 2                0.00000    1.19809
  16. RY*( 4) N 2                0.00000    3.83720
  17. RY*( 5) N 2                0.00000    0.90540
  18. RY*( 6) N 2                0.00000    1.76552
  19. RY*( 7) N 2                0.00000    2.07234
  20. RY*( 8) N 2                0.00000    2.25463
  21. RY*( 9) N 2                0.00000    2.73468
  22. RY*(  10) N 2                0.00000    2.43739
  25. RY*( 3) O 3                0.00001    1.12120

  33. BD*( 1) H 1 - N 2       0.02568    0.64620
  34. BD*( 1) N 2 - O 3       0.00000    0.12595
  35. BD*( 2) N 2 - O 3       0.00176    0.75982

[ Last edited by hliu on 2010-11-10 at 00:03 ]

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1楼 2010-11-09 23:56:26

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bird37

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★
hliu(金币+1):谢谢参与
hliu(金币+1): 2010-11-10 11:28:02

我看了一下也说不好，建议你去看一下NBO输出分析的文章吧

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2楼2010-11-10 08:54:39

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bird37

金虫 (小有名气)

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虫号: 842604

hliu(金币+1): 2010-11-10 11:27:47

有个Natural Bond OrbitalNBO 5.0 and NBOView的ppt，你可以搜一下看看

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3楼2010-11-10 08:56:20

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lihb734

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hliu(金币+5): 2010-11-10 11:27:26
hliu(金币+1):谢谢！ 2010-11-10 11:37:02

33. BD*( 1) H 1 - N 2 0.02568
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2578965&fpage=1

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4楼2010-11-10 10:18:45

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