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【求助】NBO输出求助
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如下所示的NBO输出文件中，σ*(N2-H1)轨道电子密度指哪一部分，文献上为0.02462 e NAO Atom No lang Type(AO) Occupancy Energy ------ 1 H 1 S Val( 1S) 0.67810 0.13543 2 H 1 S Ryd( 2S) 0.00281 0.70145 3 H 1 px Ryd( 2p) 0.00147 3.16277 4 H 1 py Ryd( 2p) 0.00030 2.58716 5 H 1 pz Ryd( 2p) 0.00012 2.45936 6 N 2 S Cor( 1S) 1.99985 -15.59160 7 N 2 S Val( 2S) 1.58072 -0.81976 8 N 2 S Ryd( 3S) 0.01144 1.17427 9 N 2 S Ryd( 4S) 0.00007 3.86883 10 N 2 px Val( 2p) 1.52735 -0.32644 11 N 2 px Ryd( 3p) 0.00439 0.99676 12 N 2 py Val( 2p) 1.06159 -0.17443 13 N 2 py Ryd( 3p) 0.01195 0.85110 14 N 2 pz Val( 2p) 0.80869 -0.15830 15 N 2 pz Ryd( 3p) 0.00111 0.89786 16 N 2 dxy Ryd( 3d) 0.00309 2.46203 17 N 2 dxz Ryd( 3d) 0.00038 2.07147 18 N 2 dyz Ryd( 3d) 0.00479 2.26105 19 N 2 dx2y2 Ryd( 3d) 0.00388 2.77616 20 N 2 dz2 Ryd( 3d) 0.00161 2.44932 21 O 3 S Cor( 1S) 1.99987 -20.47250 22 O 3 S Val( 2S) 1.76025 -1.19914 23 O 3 S Ryd( 3S) 0.00613 1.36895 24 O 3 S Ryd( 4S) 0.00003 3.65112 25 O 3 px Val( 2p) 1.96805 -0.54256 26 O 3 px Ryd( 3p) 0.00394 1.18999 27 O 3 py Val( 2p) 1.36692 -0.36083 28 O 3 py Ryd( 3p) 0.00133 1.29615 29 O 3 pz Val( 2p) 1.17949 -0.28886 30 O 3 pz Ryd( 3p) 0.00032 1.20406 31 O 3 dxy Ryd( 3d) 0.00215 2.38178 32 O 3 dxz Ryd( 3d) 0.00002 2.06447 33 O 3 dyz Ryd( 3d) 0.00509 2.32815 34 O 3 dx2y2 Ryd( 3d) 0.00216 2.77876 35 O 3 dz2 Ryd( 3d) 0.00055 2.30563 Summary of Natural Population Analysis: Natural Population Natural ----------------------------------------------- Atom No Charge Core Valence Rydberg Total ----------------------------------------------------------------------- H 1 0.31721 0.00000 0.67810 0.00469 0.68279 N 2 -0.02092 1.99985 4.97834 0.04272 7.02092 O 3 -0.29629 1.99987 6.27471 0.02171 8.29629 * Total * 0.00000 3.99973 11.93115 0.06912 16.00000 Natural Population -------------------------------------------------------- - Atom No Natural Electron Configuration -------------------------------- H 1 1S( 0.68) N 2 [core]2S( 1.58)2p( 3.40)3S( 0.01)3p( 0.02)3d( 0.01) O 3 [core]2S( 1.76)2p( 4.51)3S( 0.01)3p( 0.01)3d( 0.01) NATURAL BOND ORBITAL ANALYSIS: Occupancies Lewis Structure Low High Occ. ------------------- ----------------- occ occ Cycle Thresh. Lewis Non-Lewis CR BD 3C LP (L) (NL) Dev =============== 1(1) 1.90 15.95466 0.04534 2 3 0 3 0 0 0.04 ----------------------------------------------------------------------------- Structure accepted: No low occupancy Lewis orbitals -------------------------------------------------------- Core 3.99973 ( 99.993% of 4) Valence Lewis 11.95493 ( 99.624% of 12) == (Occupancy) Bond orbital/ Coefficients/ Hybrids ---------- 1. (1.99513) BD ( 1) H 1 - N 2 ( 33.20%) 0.5762* H 1 s( 99.78%)p 0.00( 0.22%) 0.9989 -0.0096 0.0442 -0.0140 0.0000 ( 66.80%) 0.8173* N 2 s( 21.88%)p 3.56( 77.92%)d 0.01( 0.20%) 0.0000 0.4677 -0.0055 0.0050 -0.8393 0.0116 0.2714 0.0308 0.0000 0.0000 -0.0080 0.0000 0.0000 0.0381 -0.0211 2. (1.99988) BD ( 1) N 2 - O 3 ( 40.75%) 0.6384* N 2 s( 0.00%)p 1.00( 99.37%)d 0.01( 0.63%) 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.9961 -0.0369 0.0000 -0.0215 -0.0767 0.0000 0.0000 ( 59.25%) 0.7697* O 3 s( 0.00%)p 1.00( 99.57%)d 0.00( 0.43%) 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.9977 0.0164 0.0000 -0.0044 0.0655 0.0000 0.0000 3. (1.99845) BD ( 2) N 2 - O 3 ( 42.86%) 0.6547* N 2 s( 26.46%)p 2.77( 73.20%)d 0.01( 0.34%) -0.0001 -0.5055 0.0952 0.0005 -0.0026 -0.0247 0.8497 0.0970 0.0000 0.0000 -0.0146 0.0000 0.0000 0.0496 0.0264 ( 57.14%) 0.7559* O 3 s( 27.74%)p 2.60( 72.05%)d 0.01( 0.21%) 0.0000 -0.5229 0.0631 -0.0003 0.0031 -0.0007 -0.8483 0.0308 0.0000 0.0000 0.0047 0.0000 0.0000 0.0401 0.0207 4. (1.99985) CR ( 1) N 2 s(100.00%) 1.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0001 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 5. (1.99987) CR ( 1) O 3 s(100.00%)p 0.00( 0.00%) 1.0000 0.0002 0.0000 0.0000 0.0001 0.0000 -0.0001 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 6. (1.99775) LP ( 1) N 2 s( 52.39%)p 0.91( 47.58%)d 0.00( 0.03%) 0.0000 0.7231 0.0320 -0.0020 0.5401 -0.0268 0.4282 -0.0102 0.0000 0.0000 -0.0125 0.0000 0.0000 -0.0025 0.0128 7. (1.99582) LP ( 1) O 3 s( 67.33%)p 0.48( 32.65%)d 0.00( 0.02%) -0.0002 0.8202 0.0228 -0.0002 -0.2691 -0.0039 -0.5040 0.0078 0.0000 0.0000 -0.0067 0.0000 0.0000 0.0111 0.0037 8. (1.96791) LP ( 2) O 3 s( 5.33%)p17.74( 94.59%)d 0.01( 0.08%) -0.0001 0.2309 -0.0002 0.0000 0.9626 0.0085 -0.1385 -0.0006 0.0000 0.0000 0.0278 0.0000 0.0000 0.0017 0.0022 9. (0.00293) RY*( 1) H 1 s( 97.82%)p 0.02( 2.18%) 0.0079 0.9890 0.0762 0.1265 0.0000 10. (0.00020) RY*( 2) H 1 s( 2.19%)p44.62( 97.81%) 0.0117 0.1476 -0.5016 -0.8523 0.0000 11. (0.00012) RY*( 3) H 1 s( 0.00%)p 1.00(100.00%) 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0000 12. (0.00001) RY*( 4) H 1 s( 0.20%)p99.99( 99.80%) 13. (0.00577) RY*( 1) N 2 s( 17.50%)p 2.29( 40.11%)d 2.42( 42.39%) 0.0000 0.0149 0.4181 0.0065 -0.0269 -0.6312 -0.0449 0.0047 0.0000 0.0000 0.6476 0.0000 0.0000 -0.0424 0.0511 14. (0.00369) RY*( 2) N 2 s( 14.93%)p 5.28( 78.83%)d 0.42( 6.25%) 0.0000 0.0488 0.3724 0.0906 0.0220 0.0358 -0.1229 0.8783 0.0000 0.0000 -0.2227 0.0000 0.0000 0.0798 0.0807 33. (0.02568) BD*( 1) H 1 - N 2 ( 66.80%) 0.8173* H 1 s( 99.78%)p 0.00( 0.22%) 0.9989 -0.0096 0.0442 -0.0140 0.0000 ( 33.20%) -0.5762* N 2 s( 21.88%)p 3.56( 77.92%)d 0.01( 0.20%) 0.0000 0.4677 -0.0055 0.0050 -0.8393 0.0116 0.2714 0.0308 0.0000 0.0000 -0.0080 0.0000 0.0000 0.0381 -0.0211 34. (0.00000) BD*( 1) N 2 - O 3 ( 59.25%) 0.7697* N 2 s( 0.00%)p 1.00( 99.37%)d 0.01( 0.63%) ( 40.75%) -0.6384* O 3 s( 0.00%)p 1.00( 99.57%)d 0.00( 0.43%) 35. (0.00176) BD*( 2) N 2 - O 3 ( 57.14%) 0.7559* N 2 s( 26.46%)p 2.77( 73.20%)d 0.01( 0.34%) -0.0001 -0.5055 0.0952 0.0005 -0.0026 -0.0247 0.8497 0.0970 0.0000 0.0000 -0.0146 0.0000 0.0000 0.0496 0.0264 ( 42.86%) -0.6547* O 3 s( 27.74%)p 2.60( 72.05%)d 0.01( 0.21%) 0.0000 -0.5229 0.0631 -0.0003 0.0031 -0.0007 -0.8483 0.0308 0.0000 0.0000 0.0047 0.0000 0.0000 0.0401 0.0207 NHO Directionality and "Bond Bending" (deviations from line of nuclear centers) Line of Centers Hybrid 1 Hybrid 2 --------------- ------------------- ------------------ NBO Theta Phi Theta Phi Dev Theta Phi Dev ==== 1. BD ( 1) H 1 - N 2 90.0 342.8 -- -- -- 90.0 159.9 2.9 2. BD ( 1) N 2 - O 3 90.0 270.0 0.0 0.0 90.0 0.0 0.0 90.0 3. BD ( 2) N 2 - O 3 90.0 270.0 90.0 271.7 1.7 -- -- -- 6. LP ( 1) N 2 -- -- 90.0 39.2 -- -- -- -- 7. LP ( 1) O 3 -- -- 90.0 241.2 -- -- -- -- 8. LP ( 2) O 3 -- -- 90.0 351.8 -- -- -- -- Second Order Perturbation Theory Analysis of Fock Matrix in NBO Basis Threshold for printing: 0.50 kcal/mol E(2) E(j)-E(i) F(i,j) Donor NBO (i) Acceptor NBO (j) kcal/mol a.u. a.u. == within unit 1 1. BD ( 1) H 1 - N 2 / 23. RY*( 1) O 3 3.23 2.19 0.075 1. BD ( 1) H 1 - N 2 / 35. BD*( 2) N 2 - O 3 1.70 1.63 0.047 4. CR ( 1) N 2 / 24. RY*( 2) O 3 0.62 17.47 0.093 5. CR ( 1) O 3 / 14. RY*( 2) N 2 2.84 21.47 0.221 6. LP ( 1) N 2 / 23. RY*( 1) O 3 2.08 2.08 0.059 7. LP ( 1) O 3 / 13. RY*( 1) N 2 1.10 2.63 0.048 7. LP ( 1) O 3 / 14. RY*( 2) N 2 4.59 2.06 0.087 8. LP ( 2) O 3 / 13. RY*( 1) N 2 5.32 2.14 0.096 8. LP ( 2) O 3 / 14. RY*( 2) N 2 1.54 1.57 0.044 8. LP ( 2) O 3 / 18. RY*( 6) N 2 0.52 2.35 0.031 8. LP ( 2) O 3 / 33. BD*( 1) H 1 - N 2 15.12 1.23 0.122 Natural Bond Orbitals (Summary): Principal Delocalizations NBO Occupancy Energy (geminal,vicinal,remote) == Molecular unit 1 (HNO) 1. BD ( 1) H 1 - N 2 1.99513 -0.86619 23(v),35(g) 2. BD ( 1) N 2 - O 3 1.99988 -0.57728 3. BD ( 2) N 2 - O 3 1.99845 -1.34232 4. CR ( 1) N 2 1.99985 -15.59152 24(v) 5. CR ( 1) O 3 1.99987 -20.47307 14(v) 6. LP ( 1) N 2 1.99775 -0.74825 23(v) 7. LP ( 1) O 3 1.99582 -1.06574 14(v),13(v) 8. LP ( 2) O 3 1.96791 -0.58139 33(v),13(v),14(v),18(v) 9. RY*( 1) H 1 0.00293 0.72937 10. RY*( 2) H 1 0.00020 2.52712 11. RY*( 3) H 1 0.00012 2.45936 12. RY*( 4) H 1 0.00001 3.17403 13. RY*( 1) N 2 0.00577 1.56193 14. RY*( 2) N 2 0.00369 0.99346 15. RY*( 3) N 2 0.00000 1.19809 16. RY*( 4) N 2 0.00000 3.83720 17. RY*( 5) N 2 0.00000 0.90540 18. RY*( 6) N 2 0.00000 1.76552 19. RY*( 7) N 2 0.00000 2.07234 20. RY*( 8) N 2 0.00000 2.25463 21. RY*( 9) N 2 0.00000 2.73468 22. RY*( 10) N 2 0.00000 2.43739 25. RY*( 3) O 3 0.00001 1.12120 33. BD*( 1) H 1 - N 2 0.02568 0.64620 34. BD*( 1) N 2 - O 3 0.00000 0.12595 35. BD*( 2) N 2 - O 3 0.00176 0.75982 [ Last edited by hliu on 2010-11-10 at 00:03 ] |
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33. BD*( 1) H 1 - N 2 0.02568 本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2578965&fpage=1 |
4楼2010-11-10 10:18:45
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