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【求助/交流】Fosmid文库双酶切切不开!急求 已有2人参与
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我今天做Fosmid克隆的双酶切,用的是EcoR Ⅰ和Hind Ⅲ的双酶切,载体大小为8100bp,我的目的片段是35Kb,参考的文献上是用这两种酶切的,而且能切开,我的结果没有切开,跑的普通琼脂糖电泳,23Kb的marker都已经跑开了,但是Fosmid没有切开,在点样孔附近有一大团。好奇怪,为什么没切开呢,我的酶量各加了1u,同时怕酶浓度太大,所以又做了酶量为0.5ul的,可是都没有切开。不知道哪里出问题了,有做过Fosmid克隆酶切的吗?急求原因了,我在想是不是有必要跑脉冲场电泳来检测啊?还是换用Not Ⅰ进行酶切呢? 非常感谢大家,这是我实验的最后一步了,如果这步做完了就基本上毕业了,谢谢大家了 ![]() |
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3楼2010-11-09 08:21:56
brightfuture01
木虫之王 (文坛精英)
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+10):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-11-08 23:10:35
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我初步分析一下: 你的凝胶浓度应该跑0.8%或者更低的; 如果你的23kb 的 lamda DNA marker都已经分开的话,那么你的质粒不应该集中在 点样孔附近,因为如果那是未酶切开的质粒的话道理上来讲应该跑出孔去的; 你在说你的酶量的时候并未说你的酶切体系大小; 我的一点怀疑及一点建议: 我怀疑你的粘粒DNA没有提取好,里面含杂质较多,要么是蛋白质,要么是基因组DNA; 我的建议是,你双酶切切不开,你做单酶切了么?比如你用EcoR Ⅰ和Hind Ⅲ的单酶切作为双酶切的对照,如果两个单酶切都能切开,这能说明什么?如果两个单酶切都切不开或者只有一个能切开,这又说明什么? 呵呵,实验做不出来的时候,再次重复的时候一定要做对照,否则盲目重复没有任何意义。 祝好运 |

2楼2010-11-08 22:47:07














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