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阿娇

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】怎样查找一个基因的启动子？？ 已有2人参与

怎样查找一个基因的启动子？？原核生物的。
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1楼 2010-11-04 18:44:32
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lwq652

木虫 (正式写手)
阿娇(金币+1):原核的。知道了基因和其上游序列，想找启动子的位置。。 2010-11-05 10:28:19
原核还是真核的？
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一念错，便觉百行皆非，防之当如渡海浮囊，勿容一针之罅漏
3楼2010-11-04 19:53:34
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槐树下

银虫 (初入文坛)
★ ★ ★
amisking(金币+3):good！ 2010-11-04 19:32:48
阿娇(金币+5):谢谢！我是克隆出了那个基因，基因和它上游的序列知道了，想找启动子的位置。 2010-11-05 10:27:33
不知道你具体是要做什么，通常可以有一些几种选择：
一是查找相关文献，即别人跟你做同一个基因，可能克隆过他的启动子，你可以在其基础上做相关的功能研究；
还有一种情况，就是没有相关报道，那么通常是将该基因在基因组上游的几KB去相关网站进行预测，看看核心启动子区域在哪里，再决定你最后克隆的片段长度为多少。
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2楼2010-11-04 19:08:35
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xulanzzz

金虫 (著名写手)
★
scelab(金币+1):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-11-04 23:18:05
阿娇(金币+4):谢谢！ 2010-11-05 10:28:52
引用回帖:
Originally posted by 阿娇 at 2010-11-04 18:44:32:
怎样查找一个基因的启动子？？原核生物的。

去一些网站上输入你的序列，软件在线分析你的启动子，如果你的序列可以在一些文献中找到的话，看看别人分析的启动子，然后Blast之后，在分析分析。。。
赞一下(2人) 回复此楼
DOBEST
4楼2010-11-04 20:59:53
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芸香菜

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
如果基因是已知的话，软件分析它的ORF，一般以ATG前的1500bp的序列记为启动子。
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5楼2012-09-03 20:30:02
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