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【求助/交流】怎样查找一个基因的启动子??
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阿娇
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【求助/交流】怎样查找一个基因的启动子??
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怎样查找一个基因的启动子??原核生物的。
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2010-11-04 18:44:32
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amisking(金币+3):good! 2010-11-04 19:32:48
阿娇(金币+5):谢谢!我是克隆出了那个基因,基因和它上游的序列知道了,想找启动子的位置。 2010-11-05 10:27:33
不知道你具体是要做什么,通常可以有一些几种选择:
一是查找相关文献,即别人跟你做同一个基因,可能克隆过他的启动子,你可以在其基础上做相关的功能研究;
还有一种情况,就是没有相关报道,那么通常是将该基因在基因组上游的几KB去相关网站进行预测,看看核心启动子区域在哪里,再决定你最后克隆的片段长度为多少。
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2010-11-04 19:08:35
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阿娇(金币+1):原核的。知道了基因和其上游序列,想找启动子的位置。。 2010-11-05 10:28:19
原核还是真核的?
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一念错,便觉百行皆非,防之当如渡海浮囊,勿容一针之罅漏
3楼
2010-11-04 19:53:34
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★
scelab(金币+1):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-11-04 23:18:05
阿娇(金币+4):谢谢! 2010-11-05 10:28:52
引用回帖:
Originally posted by
阿娇
at 2010-11-04 18:44:32:
怎样查找一个基因的启动子??原核生物的。
去一些网站上输入你的序列,软件在线分析你的启动子,如果你的序列可以在一些文献中找到的话,看看别人分析的启动子,然后Blast之后,在分析分析。。。
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DOBEST
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2010-11-04 20:59:53
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芸香菜
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★
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如果基因是已知的话,软件分析它的ORF,一般以ATG前的1500bp的序列记为启动子。
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2012-09-03 20:30:02
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好 谢谢
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2012-10-30 16:12:18
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★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问高手可以用什么软件分析启动子?
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2012-11-05 00:15:05
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能不能给推荐些软件?谢谢了!
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2012-11-05 00:15:48
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